想要纯化一个蛋白,是否应立即开始纯化实验操作?
1、想要纯化一个蛋白,是否应立即开始纯化实验操作?
答:不用着急立刻实验,在实验开始前,应该先确定目标蛋白的性质,例如分子量,等电点,可溶性,稳定性等等,这些数据可以查找相关的文献或者Uniprot等蛋白数据库;
其次,还应该确定纯化目标,不同用途对于纯化的蛋白量,纯度,活性和均一性都有不同要求;
最后,还需要根据CIPP层析策略设计纯化方案,合理利用每个层析方法的特点,提高蛋白的纯度和减少蛋白蛋白损失。
2、一个完整的亲和层析实验包括哪些步骤?
答:亲和层析的实验步骤一般分为5个阶段,包括平衡、上样、洗杂、洗脱、再生。
3、His标签蛋白纯化结合缓冲液中也要加咪唑?
答:是的,我们建议您在结合缓冲液中也可以加入少量的咪唑(20-40mM),以减少杂蛋白的非特异性吸附。
4、如何提高His标签蛋白纯化的纯度?
答:可以尝试:
(1)使用线性洗脱的方式:500 mM咪唑,0%-100%线性梯度洗脱10 CV;
(2)在镍柱纯化之后增加离子交换和分子筛等步骤继续纯化;
(3)结合缓冲液中加入少量咪唑;
(4)其他考虑方向包括His标签蛋白被部分降解,优化结合和洗脱条件,尝试不同金属离子螯合的填料,构建双标签蛋白,添加去垢剂,还原剂等添加剂破坏杂质和目的蛋白间的相互作用等等
5、Ni Sepharose excel和Ni Sepharose HP、FF有什么区别,如何选择?
答:这3款填料都是Cytiva非常经典的His标签纯化产品,各有特点:
(1)HP(High Performance)
高性能,填料平均颗粒粒径约34 μm,更细的颗粒能带来更高分辨率的分离纯化。经过HP纯化后样品峰更窄,浓度高且收集体积小,节省了后续浓缩步骤的时间。
(2)FF(Fast Flow)
快流速,填料平均颗粒粒径约90 μm,具有良好的分辨率及轻松实现规模扩大的分离纯化,更适用于Batch/重力流下的蛋白纯化和多孔板筛选。
如果纯化包涵体蛋白较多,可以优先考虑FF或FF Crude(样品可无需过滤直接上样Crude预装柱,大大节省样品的前处理时间)。
(3)Ni Sepharose Excel
镍脱落极低,而且能耐受100 mM EDTA。适合真核分泌表达的蛋白,同时可以直接不脱镍进行碱洗。
6、Ni Sepharose FF、HP、Excel 应该如何清洁再生?
答:
(1)对于Ni Sepharose FF、HP:
•首先需要用20 mM sodium phosphate,500 mM NaCl,50 mM EDTA,pH 7.4 脱镍;
•再按CIP protocols进行清洗(不脱镍直接上碱洗可能会产生棕色沉淀导致柱子堵塞);
•脱镍后可以用0.5-1 M NaOH清洗+水洗,再用100 mM NiSO4挂镍;
•结束后先水洗,保存在20%乙醇中。
(2)对于Ni Sepharose Excel:
•无需脱镍可以直接用0.5-1 M NaOH进行清洗+水洗。
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