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时空日报 | 人类躯干器官发生的自组织模型再现脊髓和脊柱的共同形态发生

2023-09-19 09:48   华大时空

破坏晚期不对称的BMP信号活性会导致早期体节阶段侧向中胚层的左右分子不对称性随机化,揭示了细胞谱系分化的分子网络活动。

大家好,欢迎观看《时空日报》第59期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计5篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要,并辅以人工审核,供了解参考。

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1人类躯干器官发生的自组织模型再现脊髓和脊柱的共同形态发生

Self-organizing models of human trunk organogenesis recapitulate spinal cord and spine co-morphogenesis

Nature Biotechnology; IF:46.900; DOI: 10.1038/s41587-023-01956-9

内容概要:通过人类多能干细胞的分化,形成了类似胚胎的前后轴。利用单细胞和空间转录组学技术,表明躯体和脊髓分化轨迹沿着这个轴线组织,并可以在外细胞基质的作用下自组装成周围被躯干包围的神经管。

2时空和单细胞解析原肠期的组织谱系轨迹和身体偏侧性

Time space and single-cell resolved tissue lineage trajectories and laterality of body plan at gastrulation

Nature Communications; IF:16.600; DOI: 10.1038/s41467-023-41482-5

内容概要:通过计算建模,构建了小鼠胚胎原始生殖层细胞群体的时空转录组。发现在胚胎早期,细胞类型逐渐多样化,而在胚胎晚期,右侧中胚层的BMP信号活性增强。破坏晚期不对称的BMP信号活性会导致早期体节阶段侧向中胚层的左右分子不对称性随机化,揭示了细胞谱系分化的分子网络活动。

3全脑代谢差异与神经血管单元完整性和突触可塑性相关基因表达的关联:以颞叶癫痫为例

Differences in whole-brain metabolism are associated with the expression of genes related to neurovascular unit integrity and synaptic plasticity in temporal lobe epilepsy

European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging; IF:9.100; DOI: 10.1007/s00259-023-06433-8

内容概要:在空间水平上对颞叶癫痫(temporal lobe epilepsy,TLE)患者进行研究,发现与神经血管单元(neurovascular unit,NVU)完整性和突触可塑性相关的基因表达与大脑代谢变化的空间相关性,表明与NVU完整性和突触可塑性相关的基因可能是介导TLE遗传风险的大脑代谢变化的驱动因素。

4肺衰老的转录变化

Transcriptional changes of the aging lung

Aging Cell; IF:7.800; DOI: 10.1111/acel.13969

内容概要:通过单细胞基因表达分析比较健康年轻和老年人肺部的转录变化,发现老化对肺部细胞的影响是异质性的,一些群体在老年人中更具转录动态性,而其他群体则保持稳定。

5scRNA-seq揭示木薯叶的发育景观

Single-cell RNA sequencing profiles reveal the developmental landscape of Manihot esculenta Crantz leaves

Plant Physiology; IF:7.400; DOI: 10.1093/plphys/kiad500

内容概要:利用单细胞转录组图谱揭示了木薯叶片的发育过程。研究发现,木薯叶片由叶肉、表皮和维管组织三种主要组织构成,分析了它们的特性和代谢活性,为进一步提高木薯产量和营养提供了理论基础。

《时空日报》是华大时空基于时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot功能板块,推出的聚焦于时空组学领域学术前沿的栏目。该栏目以实时、精准追踪时空组学前沿为目标,共享最新时空知识,助力生命科学和临床医学发展。

审校 | 沙金

题图 | 彭卫

排版 | 小飞鱼

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