时空日报 | 二甲双胍通过新型超级增强子激活前列腺素还原酶1转录程序逃避前列腺癌治疗

大家好，欢迎观看《时空日报》第38期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计7篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。

1、二甲双胍通过新型超级增强子激活前列腺素还原酶1转录程序逃避前列腺癌治疗

Metformin escape in prostate cancer by activating the PTGR1 transcriptional program through a novel super-enhancer

Signal Transduction and Targeted Therapy; IF:39.300; DOI: 10.1038/s41392-023-01516-2

内容概要：通过单细胞转录组测序，二甲双胍耐药（metformin-resistant，MetR）前列腺癌（prostate cancer，PCa）细胞群中前列腺素还原酶1（prostaglandin reductase 1，PTGR1）的表达显著增加，PTGR1过表达促进了细胞周期的进展，从而降低了对二甲双胍的敏感性。此外，还确定了显著增加PTGR1表达的关键转录因子，如SRF和RUNX3，为解决PCa中的二甲双胍耐药性提供了潜在的新靶点。

2、靶向成纤维细胞生长因子10/FGFR1在复发性类风湿性关节炎中的作用和治疗潜力

Role and therapeutic potential for targeting fibroblast growth factor 10/FGFR1 in relapsed rheumatoid arthritis

Arthritis and Rheumatology; IF:13.300; DOI: 10.1002/art.42674

内容概要：通过scRNA-seq和空间转录组学相结合的方法，发现成纤维细胞生长因子（fibroblast growth factor，FGF）通路在复发风湿性关节炎（rheumatoid arthritis，RA）患者的纤维母细胞样滑膜细胞（fibroblast-like synoviocytes，FLS）中高度激活，且FGF10的表达也增加。FGF10的siRNA敲除显著降低了RANKL的表达。FGFR1抑制剂在胶原性关节炎（collage-induced arthritis，CIA）大鼠模型中显示出治疗效果。

3、COPD是否起源于不同的细胞类型

Does COPD Originate from Different Cell Types?

American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology; IF:6.400; DOI: 10.1165/rcmb.2023-0175PS

内容概要：探讨了慢性阻塞性肺疾病（chronic obstructive pulmonary disease，COPD）的起源和不同细胞类型对其发病的敏感性。研究表明，不同的COPD表型可能是由于不同的细胞类型在早期对香烟烟雾、环境污染和感染的敏感性不同引起的。

4、scNCL：利用邻域对比正则化将标签从scRNA-seq转移到scATAC-seq数据中

scNCL: transferring labels from scRNA-seq to scATAC-seq data with neighborhood contrastive regularization

Bioinformatics; IF:5.800; DOI: 10.1093/bioinformatics/btad505

内容概要：提出了一种新的转移学习方法：scNCL，利用先验知识和对比学习来解决scRNA-seq和scATAC-seq数据之间的异质性特征问题。研究结果表明，scNCL不仅能够实现常见类型的准确和稳健的标签转移，还能够可靠地检测新型，帮助完善现有scATAC-seq图谱中的细胞类型注释。

5、单细胞测序揭示多囊卵巢综合征的卵巢景观及长期不可预测的轻微压力诱导的变化

Single-cell sequencing provides insights into the landscape of ovary in PCOS and alterations induced by CUMS

American Journal of Physiology. Endocrinology and Metabolism; IF:5.100; DOI: 10.1152/ajpendo.00165.2023

内容概要：使用scRNA-seq技术分析大鼠卵巢的转录特征，发现在卵泡细胞中，DEG Hes1的表达在多囊卵巢综合征组（polycystic ovary syndrome，PCOS）和PCOS+长期不可预测的轻微压力（chronic unpredicted mild stress，CUMS）组中更高，表现出假时表达增强，并与炎症呈正相关，为更好地理解PCOS提供了更多的认识，并确定了治疗具有心理疾病的PCOS的新生物标志物和靶点。

6、芝麻（Sesamum indicum L.）三螺旋转录因子家族在非生物胁迫下的基因组范围鉴定和表达分析

Genome-wide identification and expression analysis of the trihelix transcription factor family in sesame (Sesamum indicum L.) under abiotic stress

Molecular Biology Reports; IF:2.800; DOI: 10.1007/s11033-023-08640-w

内容概要：通过生物信息学方法鉴定了34个三螺旋基因，并将其分为六个亚家族。实时荧光定量PCR分析表明，这些基因在非生物胁迫下的表达模式不同。其中SiTH4基因在干旱和盐胁迫下显著诱导表达，表明SiTH基因可能参与了芝麻的应激响应机制。

7、空间转录组学在人类生物医学研究和临床中的应用

Spatial transcriptomics in human biomedical research and clinical application

Current Medicine; DOI: 10.1007/s44194-023-00023-4

内容概要：探讨了两种类型的空间转录组学（spatial transcriptomics，ST）—基于成像的空间转录组学（imaging-based ST，iST）和基于测序的空间转录组学（sequencing-based ST，sST），并展示了空间转录组学分析如何以时空方式跟踪疾病发病机制，寻找疾病特异性生物标记物，有望揭示基因表达、细胞增殖和相互作用的时空背景，并最终开发出治疗各种疾病的新诊断和治疗方法。 

审校 | 沙金

题图 | 彭卫

排版 | 小飞鱼

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