时空日报 | 空间转录组学揭示Duchenne肌肉萎缩小鼠模型组织病理变化的标志物

大家好，欢迎观看《时空日报》第37期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计5篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。

1空间转录组学揭示Duchenne肌肉萎缩小鼠模型组织病理变化的标志物

Spatial transcriptomics reveal markers of histopathological changes in Duchenne muscular dystrophy mouse models

Nature communications; IF:16.600; DOI: 10.1038/s41467-023-40555-9

内容概要：使用空间转录组学技术，研究了两种不同疾病严重程度的Duchenne肌肉萎缩症小鼠模型，发现Myl4、Sparc、Hspg2等基因在肌肉再生区域表达增加，Vim、Fn1、Thbs4等基因在纤维化区域表达增加，Bgn、Ctsk、Spp1等基因在钙化区域表达增加。最后，通过分化动态分析，预测了未来状态中可能受影响的肌纤维。这些发现有助于开发有效的治疗方法。

2MERFISH技术实现单细胞分辨率下小鼠视网膜的空间组织

Spatial organization of the mouse retina at single cell resolution by MERFISH

Nature communications; IF:16.600; DOI: 10.1038/s41467-023-40674-3

内容概要：使用多路复用防错荧光原位杂交技术（multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization，MERFISH）生成小鼠视网膜的单细胞空间图谱。通过与scRNA-seq数据的整合，发现8个以前未知的错位胞质细胞亚型，并建立了许多细胞亚型的分子分类与它们的空间排列之间的联系。此外，还发现了亚型之间的空间依赖性差异基因表达，表明神经元类型可能会根据位置进行功能调节。

3正电子发射断层扫描和人脑多巴胺能系统的死后基因表达揭示蛋白质分布和基因表达的关联

Association of protein distribution and gene expression revealed by positron emission tomography and postmortem gene expression in the dopaminergic system of the human brain

European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging; IF:9.100; DOI: 10.1007/s00259-023-06390-2

内容概要：通过使用正电子发射断层扫描和基因表达谱图相结合的研究策略，发现D1和D2受体的mRNA表达水平与其相应的蛋白质分布呈正相关，而多巴胺转运体的mRNA表达水平与其蛋白质分布之间没有明显的相关性，为神经影像学研究提供了更广泛的应用前景。

4周围神经损伤引起的神经病理性疼痛与星形胶质细胞衰老样反应相关

Astrocyte senescence-like response related to peripheral nerve injury-induced neuropathic pain

Cellular and Molecular Biology Letters; IF:8.300; DOI: 10.1186/s11658-023-00474-5

内容概要：该研究通过scRNA-seq技术鉴定出与星形胶质细胞衰老相关的分子反应，并验证了簇蛋白（clusterin，CLU）的表达，表明星形胶质细胞衰老可能在周围神经损伤后的神经炎症中发挥重要作用，并建议针对星形胶质细胞中CLU的激活提供新的治疗策略来治疗神经病理性疼痛。

5IFNɣ而非IFNα增加对胰岛素缺陷核糖体产物衍生抗原的识别从而放大胰岛自身免疫

IFNɣ but not IFNα increases recognition of insulin defective ribosomal product-derived antigen to amplify islet autoimmunity

Diabetologia; IF:8.200; DOI: 10.1007/s00125-023-05991-8

内容概要：通过单细胞转录组技术，发现IFNɣ诱导内分泌β细胞中编码免疫蛋白酶体β2i催化亚基的PSMB10转录本的表达，揭示了其在胰岛素缺陷型核糖体产物（defective ribosomal products，DRiP）衍生肽呈递给T细胞中的关键作用。此外，PSMB10在一种β细胞亚群中上调，这种亚群在1型糖尿病患者的胰腺中被优先破坏。这些数据强调了降解机制在β细胞免疫原性中的作用以及评估靶向免疫蛋白酶体抑制剂以限制1型糖尿病中β细胞破坏的必要性。

《时空日报》是华大时空基于时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot功能板块，推出的聚焦于时空组学领域学术前沿的栏目。该栏目以实时、精准追踪时空组学前沿为目标，共享最新时空知识，助力生命科学和临床医学发展。

审校 | 沙金

题图 | 彭卫

排版 | 小飞鱼

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