文献速览 | 实施靶向下一代测序用于常规诊断耐药结核病

Operationalising targeted next-generation sequencing for routine diagnosis ofdrug-resistant TB

Iyer A, Ndlovu Z, Sharma J，et al

Public Health Action，2023，13(2):43-49.

doi：10.5588/pha.22.0041.

研究背景

结核分枝杆菌的表型药物敏感性测试（pDST）可能需要长达8周的时间，而传统的分子检测仅可以识别有限的耐药性突变。靶向下一代测序（tNGS）为预测综合的耐药性提供快速的结果，这项研究试图在印度孟买的公共卫生实验室中探索其操作可行性。

研究方法

采用常规方法和tNGS对GeneXpert MTB/RIF检测阳性患者的同意患者的肺部样本进行耐药性检测。研究小组成员的实验室操作层面和组织实施层面的经验分享如下。

研究结果

在接受检测的患者中，70%（113/161）没有既往结核病史或治疗史；然而，88.2%（142/161）患有耐利福平/耐多药结核病（RR/MDR-TB）。tNGS和pDST对大多数药物的耐药性预测之间存在高度一致性，总体而言tNGS能更准确地识别耐药性。tNGS整合入并能够适应实验室工作流程；然而，批处理样本导致结果周转时间明显延长，最快为24天。手动DNA提取导致效率低下，因而重新优化了操作流程。分析不典型突变和结果解释需要专业技术知识。每个样本的tNGS成本为230美元，而pDST的成本为119美元。

研究结论

tNGS在参比实验室实施是可行的。它可以快速识别耐药性，应被视为pDST的潜在替代方法。

注：除非特别声明，本公众号刊登的所有文章不代表《中国防痨杂志》期刊社的观点

翻译：夏辉

编辑：于菲

审校：范永德

发布日期：2023-07-06

打赏