草酸钙结石患者尿液中lncRNA-miRNA-mRNA表达变异谱

Liang X, Lai Y, Wu W, Chen D, Zhong F, Huang J, Zeng T, Duan X, Huang Y, Zhang S, Li S, Wu W. LncRNA-miRNA-mRNA expression variation profile in the urine of calcium oxalate stone patients. BMC Med Genomics. 2019 Apr 29;12(1):57. doi: 10.1186/s12920-019-0502-y. PMID: 31036010; PMCID: PMC6489260.

背景： 探讨草酸钙（CaOx）患者尿样中长链非编码 RNA（lncRNA）、微小 RNA（miRNA）和信使 RNA（mRNA）的表达谱及其生物学功能。

方法： 氧化钙结石组纳入5例钙氧化肾结石患者，另设6名健康人作为对照组，入院时在给予任何药物前收集其晨尿中段。从尿液中提取总 RNA 后，应用 miRNA、mRNA 和 lncRNA 的微阵列来探索它们的表达变异。进行了基因本体论 (GO) 富集分析和京都基因与基因组百科全书 (KEGG) 通路分析，以揭示失调的 lncRNA 相关竞争性内源 RNA (ceRNA) 网络的基因功能。对用草酸钠 (NaOx) 处理的 HK-2 细胞进行实时定量 PCR，以进一步筛选出这些 RNA 的差异表达谱。

结果： 与正常人群相比，CaOx 患者尿液中共有 9 个 miRNA、883 个 mRNA 和 1002 个 lncRNA 差异表达。GO 分析显示，ceRNA 网络中的大部分 mRNA 在呼吸爆发、线粒体自噬调节和蛋白激酶调节活性方面得到了丰富。这些与 ceRNA 网络相关的基因的 KEGG 通路分析突出了它们在磷酸戊糖通路、乙醛酸和二羧酸代谢以及 Janus 激酶/信号转导和转录激活因子 (JAK-STAT) 信号通路中的关键作用。五种 miRNA（miR-6796-3p、miR-30d-5p、miR-3192-3p、miR-518b 和 miR-6776-3p）、四种 mRNA（NT5E、CDH4、CLEC14A、CCNL1）和六种 lncRNA（lnc-TIGD1L2 -3、lnc-KIN-1、lnc-FAM72B-4、lnc-EVI5L-1、lnc-SERPINI1-2、

结论： 差异表达的miRNAs、mRNAs和lncRNAs可能与信号通路的众多变异或代谢调控、激酶活性相关，为尿石症的早期诊断提供了潜在的生物标志物，为进一步研究尿石症机制提供了新的依据。

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