汇总!琼脂糖凝胶电泳常见问题分析及解决方法
2023-02-02 10:45
琼脂糖是从琼脂中分离得到,由1,3连接的吡喃型b-D-半乳糖和1,4连接的3,6脱水吡喃型阿a-L-半乳糖组成,形成相对分子量为104~105的长链。琼脂糖加热溶解后分子呈随机线团状分布,当温度降低时链间糖分子上的羟基通过氢键作用相连接,形成孔径结构,而随着琼脂糖浓度不同形成不同大小的孔径。表1给出了不同浓度凝胶对DNA片段的线性分离范围。
由于琼脂糖凝胶是通过氢键的作用,因此过酸或过碱等破坏氢键形成的方法常用于凝胶的再溶化,如NaClO4能用于凝胶的裂解,一般的凝胶回收试剂盒利用的也是这一原理。
随着实验技术的发展,也针对不同用途开发了各种类型的琼脂糖凝胶:
(1)低熔点琼脂糖凝胶,用于DNA片段的回收,且由于该种凝胶中无抑制酶,可在胶中进行酶切、连接等;
(2)高熔点凝胶,可分离小于1kb的DNA片段,专用于PCR产物的分析;
(3)快速凝胶,电泳速度比普通凝胶中快一倍,可节省实验时间;
(4)适用于DNA大片段的分离。
(5)其它类型。各生产商还开发很多类型的凝胶,可根据实验要求选择不同类型的,选择原则是考虑合适的机械强度和熔点。
END
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编辑:青翠欲滴
校审:晨晨
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