核酸提取干货 - MedChemExpress

2023
01/09

+
分享
评论
MedChemExpress
A-
A+

MCE 的所有产品仅用作科学研究或药证申报,我们不为任何个人用途提供产品和服务

著有 “玄学” 之称的分子生物学,师兄师姐说小 M 要做的都是 “升级打怪入门级” 的实验,然而,实验记录本上清晰地罗列着自己整理的堪称完美的 (假装看懂的 Steps) 实验流程,可是完美的流程下,总是充斥着不丝滑的操作——提 DNA,PCR,电泳,纯化回收,构载体;提 RNA,反转录,文库构建,qPCR……如何快速完成一套绝美的逆袭!!!

完美操作第一步

打好科研“地基”,从核酸提取开

核酸是遗传信息的携带者,是基因表达的物质基础,是分子生物学研究的主要对象。如果要对核酸的结构和功能进行研究,首先就要对核酸进行提取和纯化。

核酸提取是个啥?字面意思,就是把核酸从样本中提取出来呗!

那一般常见的提取方法有哪些呢?

43971673244616319

表 1.核酸提取的常见方法

提取步骤

核酸提取主要包括细胞裂解核酸吸附杂质漂洗核酸洗脱四步。那具体到实验中,我们该选择哪种提取方法呢?这就要看个人的实验设计方案及实验组的经费情况啦!

磁珠法提取效果当然很好,但贵是真的贵,而且还得购买配套的磁力架,批量提取的话,还是不太建议的!自配试剂的优缺点是显而易见的,若后续实验对核酸要求不高 (如常规的 DNA 提取,后续用做普通 PCR 扩增),这种提取方法也可选择。

但如果对核酸的质量要求比较高 (如定量或文库构建等。尤其不能忽略的是 RNA 提取中的降解和纯度问题),小 M 还是比较推荐受众度较高的离心柱法;至于质粒提取,考虑到纯度与浓度,肯定也选择这种性价比较高的离心柱法啦!  

    32211673244616587

图 1. 离心柱法核酸提取流程图

来来来,排队队,顺带开启 Kits 介绍模式……MCE 新推出三款核酸提取纯化试剂盒,均利用硅胶膜离心柱对核酸进行特异性吸附,改良的裂解液可以促进细胞充分裂解、蛋白变性、核酸释放;改良的吸附缓冲液能有效地促进核酸结合到硅胶膜上;最后经过洗脱即可获得高纯度核酸。

    Kit one (基因组 DNA 小量抽提试剂盒):我适用于从动物组织/细胞、酵母、大肠杆菌等样本中有效提取并纯化基因组 DNA,内含 蛋白酶 K 可去除蛋白污染,经纯化的基因组 DNA 后续可用于 PCR、qPCR、酶切、Southern Blot 等实验。Kit two (病毒 DNA/RNA 抽提试剂盒):我适用于从血浆、血清、全血、组织匀浆液、痰液、动物细胞上清等中提取病毒 DNA/RNA。我不仅包含蛋白酶 K,更有核酸助沉剂助力,提取的核酸那可不团团来嘛!纯化的病毒 DNA/RNA 可用于 PCR、RT-PCR、qPCR 等实验。Kit three (质粒大量抽提试剂盒):我适用于从 ≤500 mL LB 培养基培养的大肠杆菌细胞中高效的提取质粒 DNA。RNase A可对 RNA 进行清除,柱上去除内毒素,Very good!MCE 新上线核酸提取试剂盒 (离心柱型),尝鲜试用装,抓紧时间领取吧!

    完美操作第二步

    避开操作“雷区”,拿到高纯度核酸

    小M:Protocol 很完美,实际操作过程中,也难免会遇到各种小问题。

    下面小 M 对 RNA 提取过程中常见问题进行了一一盘点。

    (此处主要针对 RNA 提取,文末彩蛋有 DNA 和质粒提取注意事项汇总哦)。RNA 提取后续试验主要包括 PCR、RT-PCR、qPCR、cDNA 文库构建等,RNA 没提好,后面的实验问题也是连贯性的,一个不小心可就都 game over 了。这个 RNA 提取,真的是……脑壳疼!

    来来来,这道题,我们重点讲一下。

    影响 RNA 得率低的因素很多?抽提 RNA,当然要做到 “三从四德”。一从:外源酶污染?NO!二从:内源酶活性?NO!三从:抽提目的性?YES!一德:使用无 RNase 耗材,选择合适的操作环境。二德:确定样本后选择合适的裂解液,样本与裂解程度不匹配,抽提结果也会大打折扣。三德:裂解、匀浆、抽提、洗脱——快!准!狠!四德:衡量抽提性价比的标准是后续实验的结果,得率不是唯一标准。即我们需要明确下一步的实验,如果是 PCR,其实验本身对 RNA 的质量要求没有那么高,而 qPCR 对 RNA 的要求相对又高点,但如果要做 cDNA 文库构建,其对 RNA 的要求就很高了,因此 RNA 质量便是 “经济基础” 了,颇有 “一损俱损” 的感觉了。

    小白:“三从四德” 我也懂,但 RNA 得率这么低具体是为什么呢?

    小M:还不是因为 RNA 太娇贵,放太久会降解,环境不干净会降解,吹口气也能降解~

    15061673244616691

    彩蛋时间到!!!(含 DNA 和质粒提取注意事项)

    67861673244616861

    63641673244616952

    MCE 的所有产品仅用作科学研究或药证申报,我们不为任何个人用途提供产品和服务

不感兴趣

看过了

取消

本文由“健康号”用户上传、授权发布,以上内容(含文字、图片、视频)不代表健康界立场。“健康号”系信息发布平台,仅提供信息存储服务,如有转载、侵权等任何问题,请联系健康界(jkh@hmkx.cn)处理。
关键词:
RNA,DNA,试剂盒,核酸,提取,质粒,实验

人点赞

收藏

人收藏

打赏

打赏

不感兴趣

看过了

取消

我有话说

0条评论

0/500

评论字数超出限制

表情
评论

为你推荐

推荐课程


社群

  • “健康为民 体验提升”案例征集 加入
  • 第九季管理奖官方群 加入
  • 全院血糖管理交流群 加入
  • 医院运营管理官方群 加入
  • 手术室精益管理联盟 加入
  • 医院SPD创新管理交流群 加入

精彩视频

您的申请提交成功

确定 取消
×

打赏金额

认可我就打赏我~

1元 5元 10元 20元 50元 其它

打赏

打赏作者

认可我就打赏我~

×

扫描二维码

立即打赏给Ta吧!

温馨提示:仅支持微信支付!

已收到您的咨询诉求 我们会尽快联系您

添加微信客服 快速领取解决方案 您还可以去留言您想解决的问题
去留言
立即提交