结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.40(12.05~12.11)

2022.12.05~2022.12.11

CNS刊登文章

01 Nature

2022/12/08

“Principles of mitoribosomal small subunit assembly in eukaryotes”

线粒体核糖体合成线粒体基因组内编码的蛋白质，组装成氧化磷酸化复合物。因此，线粒体的生物发生对产生ATP和细胞代谢至关重要。

来自洛克菲勒大学的Sebastian Klinge课题组使用冷冻电镜以2.4到3.8Å的分辨率解析了天然酵母和人类线粒体小亚基组装中间体的9种结构，阐明了GTP酶如何控制解码中心形成以及如何介导初始rRNA折叠和加工的机制基础，还有线粒体蛋白在组装过程中是怎样发挥积极作用的。此外，这一系列来自两个具有不同线粒体结构的物种的中间体结构揭示了控制真核生物中线粒体小亚基成熟的保守原则和物种特异性。通过揭示组装辅助因子、线粒体蛋白和产生功能亚基所需的rRNA之间的动态相互作用，本研究的结构分析为大型核糖核蛋白组装中分子复杂性和多样性如何演变提供了结构基础.

02 Cell 

2022/12/08

“Structural visualization of the tubulin folding pathway directed by human chaperonin TRiC/CCT”

ATP依赖的环状伴侣蛋白TRiC/CCT对稳定细胞蛋白至关重要。据估计，细胞中多达 10% 的蛋白质都经由伴侣蛋白TRIC帮助，在其腔室中折叠从而获得它们最终的功能性结构。这其中包括细胞骨架微管的组成单元微管蛋白。

为了揭示为什么某些真核蛋白只能在TRiC的帮助下折叠，来自斯坦福大学Judith Frydman、Wah Chiu与韩国首尔大学Soung-Hun Roh课题组合作揭示了人类细胞中的伴侣蛋白主导微管蛋白折叠的机制。研究人员发现，非结构化的β-微管蛋白通过预折叠蛋白输送到开放的TRiC空腔，然后依赖于ATP的空腔随之关闭。研究人员利用冷冻电镜解析了在在TRiC空腔处于关闭状态下的四个近原子分辨率结构，其中包含逐渐折叠好的β-微管蛋白中间体，以及最终形成天然微管蛋白的结构。这种底物折叠途径似乎受到与TRiC空腔中保守区域的特定位点相互作用的密切指导。TRiC内壁与折叠的微管蛋白N结构域及其C端之间的初始静电相互作用建立了天然结构基础，从而实现了C端结构域折叠。空腔内内在无序的CCT C末端促进微管蛋白核心和中间结构域的折叠以及GTP的结合。这项研究首次以接近原子分辨率的精确度直接观测到了微管蛋白在分子伴侣TRiC的主动引导下定向折叠的过程，为这一重要的生理过程提供了结构知识。

Science 本周无

2022.12.05~2022.12.11

子刊刊登文章

01Nature Structural & Molecular Biology

12.05

1.“Structural insights into the regulation of Cas7-11 by TPR-CHAT”

12.08

2.“Sequence-specific remodeling of a topologically complex RNP substrate by Spb4”

02Nature Communications

12.05

1.“Structural basis of sequence-specific RNA recognition by the antiviral factor APOBEC3G”

12.07

2.“Structural basis for the non-self RNA-activated protease activity of the type III-E CRISPR nuclease-protease Craspase”

12.08

3.“The protein phosphatase 2A holoenzyme is a key regulator of starch metabolism and bradyzoite differentiation in Toxoplasma gondii”

12.08

4.“Divergent self-association properties of paralogous proteins TRIM2 and TRIM3 regulate their E3 ligase activity”

12.08

5.“Discovery and structure of a widespread bacterial ABC transporter specific for ergothioneine”

12.08

6.“Identifying antibiotics based on structural differences in the conserved allostery from mitochondrial heme-copper oxidases”

12.09

7.“Allosteric rescue of catalytically impaired ATP phosphoribosyltransferase variants links protein dynamics to active-site electrostatic preorganisation”

12.09

8.“Structural basis for a human broadly neutralizing influenza A hemagglutinin stem-specific antibody including H17/18 subtypes”

12.09

9.“Structure of the AlgKX modification and secretion complex required for alginate production and biofilm attachment in Pseudomonas aeruginosa”

12.09

10.“Selective posttranslational inhibition of CaVβ1-associated voltage-dependent calcium channels with a functionalized nanobody”

12.09

11.“Visualizing the transiently populated closed-state of human HSP90 ATP binding domain”

12.10

12.“Structure of nucleosome-bound human PBAF complex”

12.10

13.“Cryo-electron tomography reveals structural insights into the membrane remodeling mode of dynamin-like EHD filaments”

12.10

14.“A widely distributed family of eukaryotic and bacterial deubiquitinases related to herpesviral large tegument proteins”

03Science Advances

12.07

1.“High-resolution cryo-EM structure of the Shigella virus Sf6 genome delivery tail machine”

12.09

2.“Structural mechanism of extranucleosomal DNA readout by the INO80 complex”

12.09

3.“Biochemical and structural insights into SARS-CoV-2 polyprotein processing by Mpro”

12.09

4.“Autoinhibition and activation mechanisms revealed by the triangular-shaped structure of myosin Va”

Cell Research 本周无

Molecular Cell 本周无

作者 | 谭佳鑫

审稿 | 肖媛

责编 | 囡囡

设计、排版 | 可洲

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