我们发现一例DFSP患者携带一个新型杂合性胚系ERCC2突变。我们的发现扩大了DFSP患者的分子突变谱,同时也为DFSP患者的遗传咨询和靶向治疗策略提供新的参考依据。
隆起性皮肤纤维肉瘤(Dermatofibrosarcoma protuberans,DFSP)是一种罕见皮肤性软组织肉瘤,占所有软组织肉瘤的1.8%,占所有肿瘤的0.1%。DFSP进展缓慢,早期症状不明显,容易被忽略。有许多的研究已报道DNA修复基因多态性与肿瘤发生相关。ERCC2基因属于核苷酸切除修复(Nucleotide excision repair,NER)家族的一员,该基因的失活突变可导致遗传性疾病-着色性干皮症(Xeroderma pigmentosum,XP)的发生。XP患者对光照极其敏感,身体暴露在阳光下的部位发生皮肤肿瘤的风险是正常人的1000倍。
2022年8月10日,先声诊断与北京积水潭医院合作,首次报道了1例DFSP患者检测到胚系疑似致病性杂合变异ERCC2 c.105+1 G > C。此突变位于2号内含子剪接供体位置,可能会导致pre-mRNA异常剪接,影响ERCC2基因正常表达。该案例发表在Frontiers in Oncology(IF=5.738)[1]。
案例分享
一位19岁男性在2020年运动时发现右脚拇趾疼痛,拍片未见骨质破坏,之后逐渐缓解。2021年中旬在右脚趾近背端发现有一个小结节但是没有治疗,半年后该结节肿大并影响穿鞋,于是就诊当地医院并进行右背部内侧包块切除,病理诊断为隆突性皮肤纤维肉瘤(图1)。肿瘤大小为2×1cm,质地坚韧,有触痛,可移动,边界清楚,不与深部组织粘连。
图1. 病理诊断结果
患者于2022年1月进行了PET/CT检查,没有发现远端器官和淋巴转移(图2)。但患者局部皮下软组织增厚,小结节的代谢活动增加,可能是术后残留或复发。同时,对患者组织和血样进行了SimcereDx 551 gene panel的检测,发现一个杂合的胚系突变ERCC2 c.105+1 G > C。该突变既往没有被数据库记录或文献报道过,剪接位点功能预测软件MutationTaster和dbscSNV评估为致病性突变。ERCC2 c.105+1 G > C突变破坏了2号内含子剪接供体位点,可能会导致pre-mRNA异常剪接,影响ERCC2基因正常表达(图3)。
图2. 患者术后PET/CT检测结果
已知ERCC2基因功能丧失型突变是致病性的,并且ClinVar数据库记载该位点下游的ERCC2 c.594+2_594+5缺失突变是疑似/致病性突变。我们根据ACMG(American College of Medical Genetics and Genomics)分类标准,判定该位点突变是具有(疑似)致病性。同年4月,我们对患者进行家系验证,结果显示患有多发性脂肪肉瘤的父亲也携带同一杂合突变(阳性),而母亲在该突变位点是阴性(图4)。
图4. 患者父母血液样本Sanger检测结果
讨论
ERCC2基因属于NER家族一员,在基因转录和核苷酸修复过程中具有重要作用。也有越来越多的研究报道DNA损伤修复相关基因变异与肿瘤的生成和治疗响应有关。伴随BRCA1/2 和错配修复基因变异在肿瘤中的报道越来越多,其他与肿瘤发生相关的NER家族基因变异也备受关注。不同类型的ERCC2基因突变与多种类型的疾病有关,但是目前仍没有获批的靶向药可以使用。当然,也有体外实验报道以铂类化疗药物为基础的联合治疗对ERCC2突变患者有效。因此ERCC2或许也可成为一个潜在的靶向治疗位点。
异常的mRNA剪接与肿瘤的发生发展相关。例如有报道在家族性乳头状甲状腺癌患者样本中发现WDR77 c.619+1 G > C,该位点位于6号内含子5’端剪接供体,引起6号外显子跳跃,导致移码突变产生一个终止密码子,使得mRNA转录过早结束,这表明该突变触发了NMD(nonsense- mediated messenger RNA decay)过程。这个案例中的患者以及患者父亲,虽然患有不同类型的肉瘤,但是都携带有ERCC2 c.105+1 G > C,同时该位点也被软件评估为致病性突变,我们推测ERCC2 c.105+1 G > C可能与DFSP的发生有关,是导致DFSP发生的重要分子机制。
总结
我们发现一例DFSP患者携带一个新型杂合性胚系ERCC2突变。我们的发现扩大了DFSP患者的分子突变谱,同时也为DFSP患者的遗传咨询和靶向治疗策略提供新的参考依据。 END
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