同时MCP技术和策略也有望帮助鉴定出新的甲基化和突变分析组合,开发出用于其他肿瘤类型的液体活检分析模型,助力早期肿瘤筛查诊断。
2020全球癌症数据报告显示,2020年全球新发癌症病例1929万例,其中中国新发癌症 457万例。
具体在肝癌,全球 2020 年新发肝癌91万例,其中中国新发肝癌 41 万例,占全球 45% 还要多。在全球肝癌死亡患者方面,中国也是全球第一。2020 年全球肝癌死亡 83 万人,其中中国肝癌死亡 39 万人。
肝癌已成为我国最常见的癌症之一。其中肝细胞癌(HCC)占原发性肝癌的90%左右,晚期肝细胞癌的5年生存率只有12%,被人们称为“癌症之王”。
目前来说,晚期肝细胞癌的可用治疗手段有限,最佳的治疗方式就是早期发现并及时接受治疗,从而提升肝细胞癌患者的5年生存率。
那么,如何有效地在早期发现并诊断肝细胞癌,及时为患者提供治疗呢?
近期,来自国家癌症中心、中国医学科学院肿瘤医院的研究团队开发了一种新型的基于循环细胞游离DNA(Cell-free DNA,cfDNA)的肝细胞癌检测模型。
在独立验证队列中这一新模型检测的敏感性达到了90%,特异性达到了94%,有望为肝细胞癌的早期筛查提供有效助力。
这一新研究成果发表在了Science旗下子刊Science Translational Medicine期刊上。
在此前的研究中,已经证实通过多组学生物标志物(包括甲基化、突变以及蛋白质标志物等)的组合分析可以提升癌症早筛检测的灵敏度,但是大多数cfDNA分析技术只能检测一种类型的生物标志物——一次抽血中获取的cfDNA只能支持单项检测,这限制了cfDNA的应用也降低了筛查的准确性。
为了解决这一难题,研究人员开发了一项新的检测技术,即Mutation Capsule Plus (MCP)技术。MCP技术不仅支持突变和甲基化改变的并行分析(MCP 分析)以及通过甲基化CpG 串联靶扩增(CTTA)发现甲基化标记,还可以在不牺牲灵敏度的情况下对单个cfDNA 样本进行多重测试,这种全面的分析方法可以有效地对肝细胞癌患者的甲基化和突变生物标志物进行检测,提升早期筛查的敏感性和特异性。
首先,研究人员利用这项技术,对来自30例肝细胞癌患者和30例非肝细胞癌患者的cfDNA样本的甲基化标记物和突变进行了测试,构建了一组包含遗传和表观遗传学的肝细胞癌检测集成模型,通过算法对甲基化和突变进行评分,两者相结合建立肝细胞癌检测模型。
在肝细胞癌的训练队列中,这一模型对肝细胞癌的检测敏感度达到了93%(95% CI: 0.84 to 0.98),特异性达到了95%(95% CI: 0.86 to 0.99)。
肝细胞癌检测模型在训练队列中的检测效果.
随后,研究人员使用包含58个肝细胞癌患者和198个非肝细胞癌患者的独立队列来验证肝细胞癌检测模型的效果。研究结果显示:在独立验证队列中,该模型的敏感度达到了90%(95% CI: 0.79 to 0.96),特异性达到了94%(95% CI: 0.90 to 0.97)。研究结果显示:结合甲基化和突变数据可以更好地提升肝细胞癌检测模型诊断的敏感性和特异性。
除此之外,研究人员还将这一模型应用在前瞻性队列研究中。在此队列中有311名肝脏超声检查和血清AFP浓度正常的无症状乙肝病毒携带者参与研究,结果显示:肝细胞癌检测模型找到了5个肝细胞癌病例中的4个,敏感性达到了80%;特异性达到了94%。
前瞻性研究队列中肝细胞癌检测模型的敏感性和特异性检测数据.
研究人员表示,MCP技术支持对单个cfDNA样本进行多重测试,可以发现和分析与突变并行的甲基化改变,通过对多重生物标记物的数据进行分析更好地对肝细胞癌进行检测和诊断。同时MCP技术和策略也有望帮助鉴定出新的甲基化和突变分析组合,开发出用于其他肿瘤类型的液体活检分析模型,助力早期肿瘤筛查诊断。
参考资料:
Wang P, Song Q, Ren J, et al. Simultaneous analysis of mutations and methylations in circulating cell-free DNA for hepatocellular carcinoma detection. Sci Transl Med. 2022 Nov 23;14(672):eabp8704.
doi: 10.1126/scitranslmed.abp8704. Epub 2022 Nov 23. PMID: 36417488.
作者:甲基化 小小
——本期完——
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