全身性基因敲除KO全身性基因敲除KO(Knockout),是指在小鼠所有组织细胞中,将靶基因的某些重要外显子或功能结构域、甚至所有外显子敲除掉,导致靶基因的表达缺失。
最近感觉被导师针对了
发邮件不回……发微信不回……实验室里碰到……我说「老师早」,他回「嗯哼」
上一次联系导师,是由于自己的课题需要订购一批基因敲除小鼠,金额老大了。为了不出差错,实验设计了一两周,提交小鼠订购清单前发邮件征询导师的同意,但一个礼拜过去了,他还没回复。导师(nanren)的心海底针,我决定与他当面对峙。
我
老师,我那个课题用的基因敲除小鼠可以下单吗?
导师
那你说为什么订的KO小鼠,不是说订CKO小鼠吗?
我
这两种小鼠有区别吗?应该没啥影响吧。
导师
你有依据吗?最基本的文献都不看,就随便订小鼠?按这样这个课题申请下来的国自然都支撑不了你发一篇论文。你研究的是胚胎致死性基因,不能用KO小鼠。CKO小鼠模型可以提供时空特异性的基因敲除,可以提供细节更丰富、证据更确凿的研究数据。没想清楚之前别找我要钱!
本以为实验设计很充分了,结果是小鼠选错了。可是KO还是CKO小鼠?确实从一开始就没注意这个问题。查了文献资料,才了解到KO和CKO小鼠,二者在成本、制作周期、建系难度上都有着不小的差别。那到底该如何选择呢?
全身性基因敲除KO
全身性基因敲除KO(Knockout),是指在小鼠所有组织细胞中,将靶基因的某些重要外显子或功能结构域、甚至所有外显子敲除掉,导致靶基因的表达缺失。
优势:
1、小鼠模型构建周期短;
2、交配流程简单。
劣势:
1、大约有1/3的基因纯合敲除后会导致小鼠胚胎期死亡或出生期死亡;
2、引发其它基因的代偿,导致基因敲除后没有明显表型改变。
主要应用:
研究目的基因对全身生理或病理的功能。
条件性基因敲除CKO
条件性基因敲除CKO(Conditional Knockout),将某个基因的修饰限制于小鼠某些特定类型的细胞或发育的某一特定阶段,实现对小鼠基因组的时空特异性修饰。
优势:
1、多功能的基因敲除模型,可与不同工具鼠灵活搭配使用,客观而系统地研究目的基因;
2、基因在不同组织器官发生、发育或疾病发生、治疗过程中的作用与机制;
3、克服了重要基因完全敲除后的胚胎致死或过早死亡。
劣势:
1、交配流程较为复杂;
2、小鼠模型构建周期相对较长。
主要应用:
1、胚胎致死性基因的研究;
2、研究靶基因在特定组织或细胞中的功能;
3、研究靶基因在特定时期或阶段发挥的作用。
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