文献速览｜基因表达谱分析用于确定新的结核分枝杆菌潜伏感染的候选生物标记物：一项队列研究

Gene expression profiling identifies candidate biomarkers for new latent tuberculosis infections. A cohort study 

Herrera M，Keynan Y，McLaren PJ，Isaza JP，Abrenica B，López L，Marin D，Rueda ZV.

PLoS One，2022，17(9)：e0274257.

doi: 10.1371/journal.pone.0274257. 

PMID: 36170228 

目 的

测定新的结核分枝杆菌潜伏感染（latent tuberculosis infection，LTBI）者的基因表达谱，并与活动性结核病患者和接触结核病但未感染者进行比较。

设 计

采用前瞻性队列研究，招募和随访于2016年9月至2018年12月进行，2019年4月至2021年4月进行基因表达和数据处理与分析。

背 景

两所哥伦比亚男性监狱。

参与者

15例新的结核菌素皮肤试验（TST）转阳者（基线TST阴性，随访期间呈阳性），11名随访两年后TST仍呈阴性者，以及10例活动性肺结核患者。

主要观察指标

PBMC样本经RNA测序的基因表达谱。使用Bioconductor中的DESeq2包评估差异表达。| logFC |>1.0且调整后P值<0.1的基因认为表达存在差异。我们使用InterMiner分析了各组KEGG （Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）通路富集的差异。

结 果

基因表达受监禁时间的影响。我们确定了各组间具有特异的差异表达基因：新近LTBI且短期监禁（短于3个月）者的289个基因，LTBI且长期监禁（监禁1年或多年）者中的117个基因，活动性结核病患者中的26个基因，暴露但未感染个体中的276个基因。以下4条通路包含了LTBI且短期监禁患者中最多数量的基因下调和上调表达：细胞因子信号传导、信号转导、中性粒细胞脱颗粒和天然免疫系统。在LTBI且长期监禁的患者中，基因表达上调唯一的富集通路是Emi1磷酸化。

结 论

新近结核分枝杆菌潜伏感染和一种与先天免疫系统通路相关的可识别RNA谱相关，可用于指导为那些最有可能发展为活动性结核病的患者优先进行LTBI治疗。

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翻译：夏   辉

编辑：王   然   

审校：郭   萌

发布日期：2022-10-10

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