快报 | IL-13、IL-13RA1、IL-13RA2基因多态性与肺结核的关联性研究
Investigation on Probable Association Between IL-13, IL-13RA1, and IL-13RA2 Genes Polymorphism and Pulmonary Tuberculosis
Li HM, Tang F, Huang Q, Pan HF, Zhang TP.
研究背景
肺结核(PTB)是一种由结核分枝杆菌(MTB)感染引起的常见传染病,是全球主要的传染性死因之一。遗传和环境因素以及细菌感染在 PTB 发展中起关键作用。此外,细胞因子基因的多态性与 PTB 易感性密切相关。IL-13具有促进炎症免疫反应和抑制炎症反应等多种生物学功能,其有两种同源受体,称为 IL-13RA1 和 IL-13RA2,它们在体外特异性结合IL-13。本研究旨在探讨IL-13、IL-13RA1和IL-13RA2基因多态性与PTB易感性及其临床特征的关系。
研究方法
本研究通过改良多重连接酶检测反应(iMLDR)对476例PTB患者和473例对照组的9个SNP位点进行了基因分型。采用SPSS软件分析这些SNP位点与PTB发病风险之间的关系,采用SHEsis软件进行单倍型分析。
研究结果
3.1 IL-13、IL-13RA 1和IL-13RA2基因多态性与PTB易感性的关联
IL-13、IL-13RA1和IL-13RA2基因中所有SNP的基因型分布和等位基因频率如表1所示。结果显示,与正常对照相比,PTB患者IL-13 rs20541 AA基因型频率增加(AA vs GG: 调整性别、年龄后P = 0.017)。此外,rs20541变异与隐性模式下的PTB风险相关(调整性别和年龄后,AA vs GG+GA: P = 0.001)。
IL-13RA1 rs2495636 GA基因型频率在PTB患者中降低(性别、年龄调整后GA vs GG: P = 0.000)。IL13RA2基因rs5946039 A等位基因与PTB的低风险相关(调整性别和年龄后A vs T: P = 0.001)。 rs638376 CT基因型、C等位基因型、rs5946039 AA基因型频率与PTB易感性相关;然而,在Bonferroni校正后,未发现统计学上显著相关(P > 0.0055)。
3.2 PTB患者IL-13、IL-13RA 1和IL-13RA2基因SNP与临床特征的关系
研究发现,IL-13基因rs2066960、rs2069744、rs20541与PTB患者的任何临床特征之间没有统计学关联。 IL-13RA1基因中rs141573089 C等位基因频率在发热、耐药的PTB患者中低于无这些特征的PTB患者(P=0.009、P=0.032),rs141573089 CC基因型频率在白细胞减少的PTB患者中低于无此特征的PTB患者(P=0.015)(表2)。耐药的PTB患者rs2495636 AA基因型和A等位基因频率均高于无耐药的PTB患者(P=0.049,P=0.001),肺部感染的PTB患者rs2495636 A等位基因频率高于无耐药患者(P=0.041)。 IL-13RA2基因中,与耐药PTB患者相比,rs3795175 T等位基因频率增加,而rs638376 C等位基因频率降低(P=0.029,P=0.009)。
3.3 单倍型分析
采用SHEsis软件检测IL-13的5个主要单倍型(ACA、ACG、CCA、CCG、CTA), IL13RA1的4个主要单倍型(AAG、GAA、GAG、GCG), IL-13RA2的4个主要单倍型(CCA、CCT、CTT、TTT)。表3总结了PTB患者和对照组之间的这些单倍型频率分布。结果提示,PTB患者IL-13RA2 CCA单倍型频率明显低于正常对照组,而IL-13、IL-13RA1单倍型频率在PTB患者与正常对照组之间无显著差异。
研究结论
IL-13 rs20541位点、IL-13RA1 rs2495636位点和IL-13RA2 rss594603位点多态性可能与中国人群PTB的遗传背景有关。
注:除非特别声明,本公众号刊登的所有文章不代表《中国防痨杂志》期刊社的观点。
作者:厉虹淼,唐飞,黄茜,潘海峰,张天平
第一作者及单位:厉虹淼,安徽医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
通信作者及单位:张天平,中国科学技术大学附属第一医院;潘海峰,安徽医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
编辑:王 然
审校:郭 萌
发布日期:2022-08-24
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