文献速览 | 利用基于群体的结核分枝杆菌测序揭示既往疫情如何影响当前的人群动态

Population-based sequencing of Mycobacterium tuberculosis reveals how current population dynamics are shaped by past epidemics

Cancino-Muñoz I, López MG, Torres-Puente M, Villamayor LM, Borrás R, Borrás-Máñez M, Bosque M, Camarena JJ, Colijn C, Colomer-Roig E, Colomina J, Escribano I, Esparcia-Rodríguez O, García-García F, Gil-Brusola A, Gimeno C, Gimeno-Gascón A, Gomila-Sard B, Gónzales-Granda D, Gonzalo-Jiménez N, Guna-Serrano MR, López-Hontangas JL, Martín-González C, Moreno-Muñoz R, Navarro D, Navarro M, Orta N, Pérez E, Prat J, Rodríguez JC, Ruiz-García MM, Vanaclocha H; Valencia Region Tuberculosis Working Group, Comas I.

Elife，2022，11:e76605.

背 景

传播是结核病高负担地区流行的驱动因素，在低负担地区的影响可以忽略不计。然而，我们仍然缺乏在相似和不同结核病负担环境中传播动力学的完整特征。基因组流行病学可以极大地帮助量化传播，但缺乏基于人群的全基因组测序的研究阻碍了其在传播动力学中的应用。

方 法

研究在巴伦西亚地区生成了一个基于人群的数据集，并将其与来自不同结核病负担环境下的可用数据集进行比较，以期揭示结核病传播动态异质性及其对公共卫生的影响。研究对785株结核分枝杆菌的全基因组进行了测序，并将基因组信息与患者流行病学数据相关联。使用成对距离聚类方法和系统动力学方法来描述过去150年间不同结核病负担地区的传播事件。

结 果

研究结果重点体现了低负担结核病环境之间传播的显著差异，如巴伦西亚地区的成簇率（47.4%）高于牛津郡（27.0%），与马拉维等高负担地区（49.8%）相似。通过对传输链路的时间进行建模，我们观察到，高传播率环境与数十年的不间断传播相关，而与负担无关。

结 论

研究结果表明，由于既往疫情在结核病持续发病中的作用，负担和传播并不一定具有关联性，应根据不同地区的特征，强调深入描述传播动态和专门设定不同地区的结核病控制策略。

注：除非特别声明，本公众号刊登的所有文章不代表《中国防痨杂志》期刊社观点。

翻译：李    涛

编辑：孟    莉

审校：范永德

发布日期：2022-08-12

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