根据贝叶斯定理,我们可以很快的计算出,当一个人检出阳性的时候,他患病的概率为16.7%,尚不足2成,因而完全不用恐慌。
我检出一个有致病风险的基因突变,就一定会得病吗?——贝叶斯定理在基因检测结果解释中的应用
目前随着基因检测的普及,许多体检套餐中都会包含致病基因检测服务,而致病基因的结果解读也是基因检测结果分析中的重要一环。检出致病基因突变,真的代表这个客户患有这个疾病吗?理解致病基因突变的意义,对减少恐慌、正确理解基因检测结果非常重要。
假设某个基因突变在人群中的频率为1%,即有1%的人群带有该致病突变;已知检出该突变且患病的概率为99%,检出该突变但未患病的概率为1%,未检出该突变但患病的概率为5%,未检出该突变且不带菌的概率为95%。在这个预设前提下,请大家思考一下,假设某人检出了该突变阳性,那么该人患病的概率是多少?
假设没有统计学知识的时候,我们可能会觉得,由于不携带突变时患病的概率为5%,那么检出突变患病的概率就是1-5%。事实上,这个思路是错误的,解决这个问题需要运用到统计学中非常重要的一个定理贝叶斯定理。
贝叶斯定理
贝叶斯定理由英国数学家贝叶斯 ( Thomas Bayes 1702-1761 ) 发展,用来描述两个条件概率之间的关系,比如 P(A|B) 和 P(B|A)。按照乘法法则,可以立刻导出:P(A∩B) = P(A)*P(B|A)=P(B)*P(A|B),结合全概率公式可用于计算各种条件下的条件概率。贝叶斯定理的核心观点在于,对于事件A和事件B,在B发生时A发生的概率和A发生时B发生的概率是不一样的,二者有着确定的关系;用通俗易懂的观点来说,就是通过已有的条件,对原先有的信息(称之为先验概率)进行修正,得到符合已有信息情况的概率(称之为后验概率),即“从结果推原因”。 让我们再回到原来的问题,根据贝叶斯定理,我们可以很快的计算出,当一个人检出阳性的时候,他患病的概率为16.7%,尚不足2成,因而完全不用恐慌。从非统计的思维上去思考也很简单,由于人群中该突变发生的概率很低,绝大部分人都是不发生该致病突变的,而在这一大部分人中,由于检验方法的误差,也会检出许多阳性。而这些“假阳性”的个数,是远远大于”真阳性”个数的,从而导致了看上去很高的致病率实际很低。
以上例子虽然很简单,但是蕴含着临床基因检测中非常重要的一些观点:
重要观点
1.对于人群频率发生很低的疾病,检测的精确度非常重要,一点点精确度的误差都会带来大量的假阳样本,如新冠检测试剂,假如精确度不够高,会浪费大量的人力物力进行隔离,治疗,最后发现却是检测的假阳性,会带来大量的浪费
2.检测阳性的患者需要使用多种方法学进行验证,方能确保结果的准确性,单一方法的准确性受限于方法学本身,必然会引入误差。
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