Stereo-seq:哪有什么生而不凡,只是想看的更细更远!
“时空组学技术”在2020年被Nature Methods评为年度技术方法。2021年初,华大发布了自主研发的时空组学技术Stereo-seq,该技术通过时空芯片捕获组织中的mRNA,以空间条形码(Coordinate ID, CID)还原回空间位置,从而实现对组织的原位测序,为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究基础。
2022年5月4日,基于华大自主研发的高精度大视场Stereo-seq技术,绘制了小鼠胚胎发育时空图谱,相关成果在Cell 期刊在线发表。得益于Stereo-seq技术的超大视野,科研人员可以在发育中的小鼠胚胎上以超高分辨率和测序深度进行组织分析和研究。
图1 小鼠胚胎发育时空图谱相关成果在Cell 期刊在线发表
相较于国际同类技术,Stereo-seq技术拥有最大的捕获面积(13cm×13cm*),成为全球领先的、能同时实现“纳米级分辨率” 和“厘米级全景视场”的技术,且实现了基因与影像同时分析。在相同的精度下,Stereo-seq具备更灵敏和更强的mRNA捕获能力。该技术为重新认知器官结构、生命发育、物种演化和定义人类疾病提供了底层工具,推动生命科学领域第三次科技革命。
图2 Stereo-seq检测小鼠胚胎结果
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两大突破技术,为您打造专属视野场景
01
纳米级分辨率
犹如视频的蓝光模式,视觉效果呈现非常清晰。华大时空组学技术Stereo-seq的检测分辨率达到500nm,可实现对单个细胞及分子信息进行空间定位和检测。
图3 Stereo-seq技术具备超高分辨率
02
厘米级全景视场
可匹配多种较大规格的组织器官(最大捕获面积可达13cm×13cm*),呈现更广阔的视野,对人、动物的大尺寸组织器官进行转录组信息分析,实现器官和生命全景分子细胞图谱的绘制。
图4 利用Stereo-seq技术构建小鼠胚胎发育图谱
目前,华大在时空组学方向实现工具自主可控,通过在生命时空图谱、物种演化、疾病病理机制研究和药物开发、治疗等领域规模化应用,未来将全面提升人类对生命的认知,推动对疾病的重新定义。
对时空组学或单细胞组学整体解决方案感兴趣的老师,可选择以下方式和我们联系,我们将及时为您进行详细的介绍:
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2. 发送信息至邮箱:
collaboration@stereomics.com。
注:13cm*13cm为芯片尺寸产出理论值,实际项目芯片尺寸可根据具体项目进行评估。
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