文献速览｜基于单细胞转录组学测序的方法研究活动性肺结核患者肺泡灌洗液中肺泡巨噬细胞特征

Characteristics of alveolar macrophages in bronchioalveolar lavage fluids from active tuberculosis patients identified by single-cell RNA sequencing

Chen Qianqian，Hu Chunmei，Lu Wei，Hang Tianxing，Shao Yan，Chen Cheng，Wang Yanli，Li Nan，Jin Linling，Wu Wei，Wang Hong，Zeng Xiaoning，Xie Weiping.

J Biomed Res，2022 ：167-180.

DOI: 10.7555/JBR.36.20220007

PMID: 35635159

研究背景

结核病是全球十大死因之一，中国是结核病高负担国家。巨噬细胞在结核病发生发展中起到重要作用，其在人体内具有异质性和多样性。

研究方法

应用10X Genomics单细胞转录组测序的方法对收集的3例活动性肺结核患者肺泡灌洗液中的细胞进行单细胞测序，以公共数据库中3例健康人肺泡灌洗液细胞作为对照，对肺泡巨噬细胞进行差异表达基因分析、功能富集分析、极化状态分析；通过拟时序分析法探索巨噬细胞亚群极化关系；使用CellChat算法分析细胞间信号通讯网络。

研究结果

在9个肺泡巨噬细胞亚群中，肺结核患者有5个肺泡巨噬细胞亚群占比显著高于健康人。功能富集分析表明，在肺结核患者中占比升高的肺泡巨噬细胞亚群除了与巨噬细胞吞噬、抗原提呈功能相关信号通路有关外，还与炎症、细胞免疫等信号通路有关。通过对肺结核患者升高肺泡巨噬细胞亚群拟时序分析发现，自起点亚群后，先向具有M1型特征的亚群分化，再向具有M2型特征的亚群分化。肺结核患者肺泡巨噬细胞和其他类型细胞、肺泡巨噬细胞内部之间的细胞通讯在数量和通讯强度上较健康人明显增加。

研究结论

肺结核患者肺泡灌洗液中肺泡巨噬细胞具有独特的基因表达特征及功能极化状态。肺结核患者占比增高的肺泡巨噬细胞亚群可能存在先向M1型极化、再向M2型转化的过程。肺结核患者肺泡巨噬细胞相关的细胞通讯数量和强度明显增加。

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编辑：王   然

审校：郭   萌

发布日期：2022-06-21

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