学术先声丨【ASCO 2022】先声诊断学术成果特辑Vol. 2
美国临床肿瘤学会(ASCO)年会是全球肿瘤领域权威的学术交流盛会,展示当前国际前沿的临床肿瘤学科研成果和肿瘤治疗技术,汇聚众多世界一流的肿瘤学专家和医药公司参会。2022年度的ASCO年会已于6月3日到7日在芝加哥以线上线下形式成功举办。
作为中国领先的精准医疗解决方案提供商,先声诊断凭借扎实的科研实力,一直位于精准医疗研究前沿。本届ASCO学术盛会上,先声诊断携手多家知名医院的多位临床专家,合作发表了50篇临床转化医学成果,其中11项以学术壁报(Poster)形式展示。本期《学术先声》栏目将为大家继续带来两篇精彩Poster的解读分享。
PAK家族基因可作为泛癌种免疫检查点抑制剂的潜在Biomarker
A pan-cancer analysis of P21 activated kinase (PAK) family genes as potential biomarkers for immune checkpoint therapy
报告形式:Poster
研究者:新疆医科大学附属肿瘤医院 孙刚
研究例数:1910
摘要编号:2614
背景: PAK(P21活化激酶)是由六个家族成员(PAK1-6)组成的激酶家族,位于与肿瘤发生相关的多个信号通路的交叉点。近年来研究发现PAK家族基因突变与抗肿瘤免疫之间存在关系。本研究基于多种实体瘤的多维度数据,探索了PAK家族基因突变与免疫检查点抑制剂响应的关系。 方法: 采用免疫治疗队列(Broad/Dana-Farber, Nat Genet 2018, N = 249)作为发现队列,探索了七种肿瘤中PAK家族基因突变与肿瘤突变负荷(TMB)及免疫治疗疗效的关系。并且为了进一步验证PAK家族基因的预测价值,运用另一个泛癌种免疫治疗MSKCC队列(Samstein, Nat Genet 2019, N = 1661)作为验证队列。
结果: 在发现队列中,PAK-Mut组的OS更长(mOS: 31.3 vs 15.4个月,HR= 0.59, 95% CI: 0.36-0.96,P=0.03;图1)。将两组的TMB进行比较,发现PAK-Mut 组TMB相对更高(P<0.001),两组的TMB中位数分别为17.79 Mut/Mb(IQR, 7.45-36.55)和5.47 Mut/Mb(IQR, 2.46-9.09;图2)。同样的,验证队列中PAK-Mut患者也获得了显著的OS改善(mOS: 44.0 vs 17.0月,HR=0.51, 95% CI: 0.37 - 0.69, P<0.001;图3)。在验证队列中,与PAK-Wt组相比(median IQR:5.90[2.95-10.04]),同样也是PAK-Mut组(median IQR: 21.19[11.81-43.29])的TMB更高(P<0.001;图4)。此外在经年龄、性别、转移、治疗、TMB、癌症类型等因素校正后的多因素分析也同样显示PAK-Mut与更长的OS相关(HR= 0.71;95%CI:0.52-0.98;P = 0.036;图5)。
结论:结果表明,PAK家族基因突变与较高的TMB相关。免疫治疗队列数据分析显示PAK家族与较好的OS相关。这些结果表明,PAK家族基因突变可能作为实体肿瘤患者ICI治疗疗效的潜在预测生物标志物。
图1. 发现队列PAK家族基因突变状态与患者OS的关系
图2. 发现队列中PAK家族基因突变状态与TMB水平
图3. 验证队列PAK家族基因突变状态与患者OS的关系
图4. 验证队列中PAK家族基因突变状态与TMB水平
图5. 验证队列 OS的多因素COX回归分析
胃癌中B7-H6的表达与免疫微环境相关
The expression of B7-H6 is associated with a better immune microenvironment in gastric cancer
报告形式:Poster
研究者: 烟台毓璜顶医院 陈剑
摘要编号:4025
背景: B7- H6(NCR3LG1),是是自然杀伤(NK)细胞激活受体NKp30的配体,可与NKp30结合,诱导NK细胞活化和细胞因子分泌,发挥抗肿瘤作用。 有研究报道,B7-H6的表达与癌症患者术后预后及远处转移情况显著相关。在胃癌患者中,B7-H6高表达与较长的OS显著相关。 然而,B7-H6对免疫治疗和免疫微环境的影响尚不清楚。 本文利用TCGA胃癌数据库数据,分析B7-H6表达对免疫微环境的影响。
方法:从TCGA数据库(http://cancergenome.nih.gov)中提取胃癌的基因表达谱和临床资料。根据报道,选取15作为B7-H6表达的阈值,根据B7-H6的表达分为高表达组(B7-H6表达>15)和低表达组(B7-H6表达≤15)。采用Kaplan-Meier生存分析验证B7-H6表达对OS的影响。用CIBERSORT算法分析两组免疫相关细胞的比例,用ESTIMATE算法分析两组基质评分和免疫评分,并计算两组免疫相关Signature的差异。
结果:Kaplan-Meier生存分析显示,高表达组总生存期较长(p value=0.016),与既往报道一致。CIBERSORT算法结果显示,低表达组激活免疫相关CD8(+) T细胞和NK激活细胞比例显著高于高表达组(p value <0.05)。低表达组免疫抑制相关的CD4 resting memory T细胞比例显著低于高表达组(p value <0.05)。ESTIMATE算法结果显示,低表达组基质评分、免疫评分和ESTIMATE评分显著高于高表达组(p value <0.01)。免疫相关Signature,包括immune signature, expanded immune signature, TLS signature, myeloid cell chemotaxis, tertiary lymphoid structure,低表达组显著高于高表达组(p value <0.05)。
结论:胃癌中B7-H6低表达与良好的免疫微环境有关。B7-H6表达对免疫治疗的影响有待进一步研究。
图1. 不同分组的Kaplan-Meier生存分析(左)和ESTIMATE算法结果(右)
图2. CIBERSORT算法(上)和免疫相关Signature结果(下)
关于ASCO
美国临床肿瘤学会(American Society of Clinical Oncology,ASCO),是世界上最大的、最具影响力的、全球领先的肿瘤专业学术组织。 学会有来自100 多个国家超过40000名会员,其中三分之一来自美国以外。 会员包括肿瘤学领域及其专科之临床肿瘤科医师、参与认可的肿瘤学训练计划的医师和医疗专家、肿瘤科护士以及肿瘤科执业医师,带来最前沿的抗癌技术与药物,公开最新的临床研究成果。
撰写丨 谭渊 / 骆宁宁
编辑、排版丨SX
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