Cell子刊:王鹏飞/张文宏/胡子欣团队全面评估奥密克戎各亚型的免疫逃逸能力

2022
05/12

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当前,新冠病毒奥密克戎(Omicron)变异株已在全世界大范围流行,世卫组织从一开始就将其列为受关注的变异株(VOC)。

当前,新冠病毒奥密克戎 (Omicron) 变异株已在全世界大范围流行,世卫组织从一开始就将其列为受关注的变异株 (VOC) 。该变异株后来又被划分为四个亚谱系,分别命名为:BA.1,BA.1.1,BA.2 和 BA.3。最初的 Omicron (BA.1) 于2021年11月在博茨瓦纳和南非首次被发现,又与其衍生变异株 BA.1.1 (含有额外的S蛋白R346K突变) 一起在几周内成为全球替代德尔塔 (Delta) 的主导流行株。

随后,亚谱系 BA.2 的迅速传播,成为全球的主要变体。复杂又高频的病毒突变会给现有的疫苗效用带来巨大挑战。因此,迫切需要比较所有主要 Omicron 亚谱系对现有疫苗引发或单克隆抗体 (mAb) 介导的中和的敏感性。

2022年5月8日,复旦大学 王鹏飞张文宏胡子欣 团队在 Cell 子刊  Cell Host & Microbe 上在线发表了题为: Antibody Evasion of SARS-CoV-2 Omicron BA.1, BA.1.1, BA.2 and BA.3 Sub-lineages  的研究论文。

该研究使用基于 VSV 的假病毒研究发现接种两剂灭活疫苗 (BBIBP-CorV) 的个体血清对于 Omicron,显示出非常弱或几乎没有中和活性而同源的灭活疫苗加强针或蛋白亚单位疫苗 (ZF2001) 异源加强针则能显著改善针对所有 Omicron 变体的中和滴度

研究进一步评估了20个单克隆抗体的中和情况,其中包括10个已经授权或批准的。大多数单克隆抗体在 Omicron 亚谱系中完全或基本上失去了中和活性,仅个别单克隆抗体仍保留较好的中和效果。

综上所述,所有四个 Omicron 亚谱系都威胁到当前疫苗和抗体疗法的有效性突出了推广疫苗加强针对抗新冠新变体的重要性。

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之前就报道过康复者或 BBIBP-CorV 疫苗接种血清对 BA.1 的中和活性显著降低。在这里,研究团队指出这些多克隆血清对其他 Omicron 亚谱系的中和活性下降幅度与 BA.1 相当甚至更大,表明所有这些亚谱系与原始病毒具有非常远的抗原距离。

研究团队认为 BA.2 相对于 BA.1 的选择性优势应该主要归因于其更高的传播性而不是免疫逃避。另一方面,研究者指出接种同源灭活疫苗加强针或异源蛋白质亚单位疫苗加强针可以显著提高 Omicron 的中和滴度。最近报道的一些新冠重组毒株 (XD,XE和XF) ,因为它们的 S 蛋白与 BA.1 或 BA.2 相同,它们的抗体逃避应该与这里研究的 Omicron 亚谱系类似。因此,推广疫苗加强针注射仍然是预防新冠病毒传播的有效手段。

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该研究还通过单克隆抗体 (mAbs) 研究了 Omicron 亚谱系的免疫逃逸能力。与研究团队对 BA.1 的报告类似,大多数单克隆抗体对 BA.1.1、BA.2 和 BA.3 的中和活性完全或大幅度丧失。但研究团队也观察到某些单克隆抗体对于这些病毒呈现出不同的中和模式。例如,S309 和 5-7,是两个之前报道对 BA.1 基本保持活性的单克隆抗体,但它们的活性被 BA.2 进一步逃逸。而另一些单克隆抗体如 COV2-2130 和 2-7 对 BA.1 完全失去了活性,但对 BA.2 又恢复了活性。好消息是 LY-CoV1404 或 bebtelovimab 对所有 Omicron 亚系和其他主要的病毒变体都保持有效的中和活性。

研究团队还构建了所以这些病毒携带的单点突变和某些突变组合,并全面地评价了20种单克隆抗体对这些突变的中和能力研究,绘制了一张详细的抗体中和图谱。研究指出,尽管 LY-CoV1404 目前仍然是治疗性抗体的希望,但鉴于 RNA 病毒的易突变特性,如果将其作为单一疗法长期施用,仍可能会出现耐药性。因此,作者倡议开发更高效、广泛的中和抗体混合使用,以对抗不断变异的病毒。

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复旦大学附属华山医院艾静文,复旦大学王勋何欣怡赵晓宇,华山医院张怡以及拜盖特生物姜钰超为论文的共同第一作者,复旦大学生命科学学院以及上海市重大传染病和生物安全研究院双聘PI王鹏飞张文宏以及复旦大学现代人类学教育部重点实验室和复旦大学人工智能创新与产业研究院胡子欣为论文的共同通讯作者。

复旦大学生命科学学院以及上海市重大传染病和生物安全研究院双聘PI王鹏飞,长期致力于艾滋病、新冠等传染病的防治研究。相关成果以第一/通讯作者身份已发表在 Nature(三篇), Cell Host & MicrobePNASNucleic Acids Research 等众多国际学术期刊。现因课题需要,面向海内外公开招聘博士后2名,另外课题组常年接收硕博研究生和本科生,欢迎有志向的青年才俊加入。

更多个人信息详见:

https://life.fudan.edu.cn/e5/6d/c28175a386413/page.htm

论文链接

https://doi.org/10.1016/j.chom.2022.05.001

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关键词:
活性,单克隆抗体,中和,研究,谱系

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