2021年世界卫生组织耐药性相关结核分枝杆菌复合群突变目录

The 2021 WHO catalogue of Mycobacterium tuberculosis complex mutations associated with drug resistance: A genotypic analysis.

Walker TM, Miotto P, Köser CU, Fowler PW, Knaggs J, Iqbal Z, Hunt M, Chindelevitch L, Farhat M, Cirillo DM, Comas I, Posey J, Omar SV, Peto TE, Suresh A, UplekarS(12), Laurent S, Colman RE, Nathanson CM, Zignol M, Walker AS, CRyPTIC Consortium; Seq&Treat Consortium; Crook DW, Ismail N, Rodwell TC.

Lancet Microbe, 2022, 3(4):e265-e273.

doi: 10.1016/S2666-5247(21)00301-3.

PMID: 35373160.

研究背景

分子诊断被认为是快速实现结核分枝杆菌复合物（MTBC）药物敏感性试验（简称“药敏试验”）最有希望的通用途径。我们的目的是编制一份世界卫生组织（WHO）认可的突变目录，作为解释耐药性预测分子信息的全球标准。

研究方法

采用候选基因的方法，对与13种WHO认可的抗结核药物的耐药性相关或易感性一致的突变进行确定。从45个国家收集了具有配对的全基因组测序和表型药敏测试数据的38 215株MTBC分离株。对于每个突变，通过表型和是否存在突变的二元列联表计算阳性预测值。使用Fisher精确概率法检验其优势比，使用Benjamini-Hochberg法校正P值。如果在至少5株分离株中存在突变，或优势比大于1且具有统计学显著的校正P值，又或表型耐药性阳性预测值的95%置信区间下限大于25%，则将突变分级判定为与耐药性相关。一系列专家规则被应用于每个突变的最终可信度分级。

研究结果

对与1种或多种药物相关的13 211个独特突变的15 667个关联进行了计算。7.3%（1149/15 667）的突变被归类为与表型耐药相关，0.7%（107/15 667）的突变被认为与易感性一致。对于利福平、异烟肼、乙胺丁醇、氟喹诺酮类药物和链霉素，突变的合并敏感度超过了80%。除乙硫异烟胺（91.4%）、莫西沙星（91.6%）和乙胺丁醇（93.3%）外，所有药物的特异度均超过95%。但因贝达喹啉、德拉马尼、氯法齐明和利奈唑胺的表型耐药率均较低，在这些药物中只有两种耐药突变。

研究解释

这是第一个WHO认可的用于MTBC药物敏感性试验的分子靶标目录，它为耐药性解释提供了全球标准，有助于鼓励国家结核病规划实施分子诊断。

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翻译：阮云洲

编辑：孟    莉

审校：范永德