快报 | 基于DTM-PCR和MIRU-VNTR基因分型技术的耐多药结核病家庭内传播研究

Transmission of multidrug-resistant tuberculosis within family households by DTM-PCR and MIRU-VNTR genotyping.

Chen J, Chen L, Zhou M, Wu G, Yi F, Jiang C, Duan Q, Zhou M.

BMC Infect Dis, 2022, 22(1):192.

doi: 10.1186/s12879-022-07188-7.

PMID: 35219320

近日，《BMC传染病》（BMC Infectious Diseases）杂志发表了武汉市肺科医院的一项关于耐多药结核病（MDR-TB）在武汉市家庭内人群传播规律的研究（Transmission of multidrug-resistant tuberculosis within family households by DTM-PCR and MIRU-VNTR genotyping. BMC Infect Dis, 2022, 22(1): 192. doi: 10.1186/s12879-022-07188-7.）。研究显示，MDR-TB患者的家庭密切接触者有一定感染耐多药结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）的风险。为减少MDR-TB的传播，应尽早确诊，及时有效治疗，并积极对家庭内密切接触者进行结核感染相关筛查。

研究背景

据世界卫生组织2020年结核病年度报告，2019年估计有利福平耐药结核病（RR-TB）患者46.5万例，其中 78%为MDR-TB，以印度（27%）、中国（14%）和俄罗斯（8%）的耐药结核病占比最多，已成为我国持续危害人群健康的重大公共卫生问题。

近年来，国内关于MDR-TB在家庭内传播的研究还较少，但随着分子生物学技术的发展，目标缺失多重PCR（deletion-targeted multiplex，DTM-PCR）和MIRU-VNTR（Mycobacterial interspersed repetitive unit–variable number tandem repeat typing）等基因分型技术已逐渐成为MDR-TB分子流行病学研究中的重要工具。本研究采用DTM-PCR和24位点MIRU-VNTR分型法进行家庭内MDR-TB患者结核分枝杆菌的基因分型。

研究设计

1. 材料来源：选取2007年1月至2018年3月武汉市肺科医院登记的993例MDR-TB控制项目中的全部患者，其中家系成员共计49例。采集49例患者MTB分离株，共计获得MTB分离菌株22株，置于－80 ℃的菌株库中保存；另27株菌株因丢失或失活而未能获取。

2. MIRU分型：选取国际标准24位点，分别为MIRU02、Mtub04、ETRC、MIRU04、MIRU40、MIRU10、MIRU16、Mtub21、MIRU20、QUB11b、ETRA、Mtub29、Mtub30、ETRB、MIRU23、MIRU24、MIRU26、MIRU27、Mtub34、MIRU31、Mtub39、QUB26、QUB4156、MIRU39。

3. DTM-PCR：采用Khosravi AD等描述的DTM-PCR分型法对所有分离菌株进行分型。根据基因型（成簇型和独立型）是否相同来判断菌株的型别。将2株及以上具有完全相同基因型的MTB分离株判断为成簇型。

研究结果

家庭首发病例和二代病例的时间间隔从 0.5～110个月。13例二代病例在2年内发展为活动性MDR-TB，占全部二代病例的50%（13/26）。首发和二代病例的人口学等特征和耐药表型见表1。

采用UPMGA法绘制最小分类树，见图2。在11对MDR-TB家庭中，6对有相同的基因型，基因成簇率为54.5%（12/22）；3对有1个位点的 MIRU-VNTR发生变异。如果将1个位点的 MIRU-VNTR变异定义为基因成簇，则成簇率提高至81.8%（18/22）。

研究意义与展望

本研究将MIRU-VNTR和DTM-PCR基因分型方法与传统流行病学调查相结合，对武汉市MDR-TB家庭内传播模式进行回顾性探讨。发现MDR-TB患者的家庭密切接触者有一定感染MDR-TB的风险。为减少传播，应对MDR-TB患者早诊断、早治疗，同时应对家庭密切接触者进行结核感染相关筛查，并至少随访2年。

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编辑：孟    莉

审校：范永德

发布日期：2022-03-17

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