科研快讯 | 华山医院：新一代宏基因组测序在不明原因发热临床应用的评估

2022

01/25

微生态

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在FUO中应用mNGS的诊断效果明显高于培养法或其他常规方法。

编译：微科盟索亚，编辑：微科盟索亚、江舜尧。

导读

2022年1月21日，复旦大学附属华山医院艾静文团队等人在Frontiers in Cellular and Infection Microbiology发表题为《Evaluations of Clinical Utilization of Metagenomic Next-Generation Sequencing in Adults With Fever of Unknown Origin》的文章。

研究背景：不明原因感染引起的发热（FUO）的诊断仍然具有挑战性，使得医生很难提供早期有效的治疗。因此，需要一种新型的病原体检测平台。新一代宏基因组测序（mNGS）为病原微生物的序列鉴定提供了一种客观、全面的方法，但关于mNGS在FUO中的诊断价值的研究仍然有限。

方法：在一项回顾性单中心队列研究中，纳入了175例FUO患者，记录和分析临床资料，将mNGS与培养法或传统方法，包括涂片法、血清学检测和核酸扩增检测（NAAT，传统PCR、Xpert MTB/RIF和Xpert MTB/RIFUltra）进行比较。

结果：与培养法和常规方法相比，血液mNGS可使感染引起的FUO中检出新微生物的比率分别提高22.9%（22/96 vs. 0/96；RO，∞；P = 0.000）和19.79% （19/96 vs. 3/96；RO，6.333；P = 0.001）。血液感染是确诊病例中数量最多的一组，与培养法相比，血液mNGS的诊断率提高了38%（19/50 vs. 0/50；RO，∞；P = 0.000）和32.0% （16/50 vs. 3/50；RO，5.333；p = 0.004）。在感染引起FUO的非血液样本中，可以观察到mNGS在感染性疾病中的总体诊断性能比传统方法好20%（9/45 vs 2/45；RO，4.5；p = 0.065），在非血液感染中使用非血mNGS可使诊断率提高26.2%（8/32 vs. 0/32；RO，∞；p = 0.008）。根据175例患者的临床决策，我们发现使用血液mNGS作为一线检测，会比培养法有效提高了10.9%的FUO诊出率，将可疑部位mNGS作为二线检测策略有利于感染患者，可以提高并发感染的诊断率66.7%和非血液感染的诊断率12.5%。

结论：在FUO中应用mNGS的诊断效果明显高于培养法或其他常规方法。在感染引起的FUO患者中，采用血液mNGS作为一线调查，疑似感染部位样本的鉴定作为二线检测，可提高FUO的整体诊断率，是未来有希望的优化诊断方案。

关键词：新一代宏基因组测序，不明原因发热，精准诊断，病因，应用

论文ID

原名： Evaluations of Clinical Utilization of Metagenomic Next-Generation Sequencing in Adults With Fever of Unknown Origin

译名：新一代宏基因组测序在不明原因发热成人中的临床应用评估

期刊：Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

IF：5.293

发表时间：2022.01.21

通讯作者：艾静文

通讯作者单位：复旦大学附属华山医院

DOI号：10.3389/fcimb.2021.745156

实验设计

从2017年3月至2018年8月登记在华山医院所有不明原因感染引起的发热（FUO）的患者，经过评估后，175名FUO患者纳入本研究。采集受试者血液样本、其它感染部位样本（痰液、支气管肺泡液、脑脊液、尿液、穿刺液、胸膜液、NPS以及生物组织）。血液也不能同时进行新一代宏基因组测序（mNGS）和培养。根据临床需要进行血常规、血生化、自身免疫抗体、常规致病方法检测，如涂片法、血清学检测和核酸扩增检测（NAAT，传统PCR、Xpert MTB/RIF和Xpert MTB/RIFUltra）。通过比较不同检测方法的效率，评估mNGS在FUO中应用的临床价值。

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