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图片来源：罗马儿童医院科研团队发布奥密克戎的全球首张图片
奥密克戎变异株能否被核酸检测100%检测出？我国现使用的核酸检测试剂是否有影响？
国家卫健委官微指出：奥密克戎变异株突变的位点主要集中在S蛋白基因的高变异区，并不位于我国第八版《新型冠状病毒肺炎防控方案》公布的核酸检测试剂引物和探针靶标区域（中国疾控中心病毒病所向全球公布的ORF1ab基因和N基因）。但南非多个实验室的数据提示，对于检测靶标为S基因的核酸检测试剂可能无法有效检出奥密克戎变异株的S基因。 今日（12月14日），广州市召开疫情防控新闻发布会，广州市卫健委、越秀区、市疾控中心相关负责人将通报广州市新冠肺炎疫情防控相关情况。会议指出，广州发现首例境外输入奥密克戎阳性病例。该病例为男性，67岁，家住越秀区华乐街天胜村65号。11月27日从国外入境，集中隔离期间多次核酸检测均阴性。12月11日，解除隔离后乘飞机（CA1837）返回广州，闭环转运至越秀区家中居家隔离；12日，华乐街社区卫生服务中心为其例行采集核酸标本，
13日凌晨通报结果初筛阳性，经市、区疾控中心重采样复核结果均为阳性。
病例闭环转运至广州医科大学附属市八医院隔离治疗，经进一步检查和专家会诊，确诊为新冠肺炎普通型，目前病情稳定。广州市疾控中心对该病例的鼻拭子进行新冠病毒全基因组测序和序列分析，经省市疾控中心复核，
报国家疾控中心确认，检出新冠病毒为奥密克戎变异株
。截至12月14日12时，累计排查到重点场所筛查人员10544人，已出结果均为阴性。累计采集环境样本132份，128份环境样本检测结果阴性，4份阳性均为病例住所发现。香港特区政府卫生署卫生防护中心14日公布，截至当日零时，香港新增5例输入性新冠肺炎确诊病例。目前，香港累计报告新冠肺炎确诊病例12495例。昨日公布的1例确诊病例今证实涉“奥密克戎”变异病毒株，
香港至今共录得8例涉及“奥密克戎”的病例12月13日，
据天津市疫情防控指挥部消息，
天津市疾病预防控制中心对12月9日天津市境外输入新冠病毒无症状感染者呼吸道标本进行新冠病毒全基因组测序和序列分析，经中国疾病预防控制中心复核，均确认检出新冠病毒奥密克戎变异株（B.1.1.529进化分支）。在天津感染者系入境闭环管控人员，目前于定点医院隔离治疗。据悉，这是中国内地首次发现新冠病毒奥密克戎变异株。据央视新闻，天津市新冠疫情防控指挥部办公室主任、天津市卫健委主任顾清介绍，天津此次发现的奥密克戎变异株，来自欧洲的入境人员，该人员在天津入境时体温正常，申报无异常。经海关检疫排查采样后，全程闭环管理转送至西青区集中隔离医学观察点。12月9日新冠病毒核酸检测结果为阳性，即由120救护车转送至海河医院就诊。该病例是一名无症状感染者，目前无咳嗽、发烧等症状，正在天津新冠肺炎定点收治医院进行隔离。据分析，该病例作为入境人员，航班上有可能会存在阳性感染者。到目前为止，在对该航班入境人员的核酸检测中，尚未发现存在其他感染者。在12月11日召开的国务院联防联控机制新闻发布会上，国家卫生健康委新闻发言人米锋表示，当前新冠肺炎疫情全球大流行仍处于发展阶段，周新增确诊病例继续超过400万例，死亡率出现上升，奥密克戎变异株进一步增加了疫情不确定性，我国“外防输入”压力持续增大。针对新冠病毒奥密克戎变异株，国家卫生健康委组织中国疾控中心专家就有关问题进行了公开解答。2021年11月9日，南非首次从病例样本中检测到一种新冠病毒B.1.1.529变异株。短短2周时间，该变异株即成为南非豪登省新冠感染病例的绝对优势变异株，增长迅猛。11月26日，WHO将其定义为第五种“关切变异株”（variant of concern, VOC），取名希腊字母Omicron（奥密克戎）变异株。奥密克戎变异株在南非首先发现和报道，但不代表这个病毒是在南非演变形成的，变异株的发现地不一定是起源地。根据新冠病毒数据库GISAID目前共享的信息显示，新冠病毒奥密克戎变异株的突变位点数量明显多于近2年流行的所有新冠病毒变异株，尤其在病毒刺突（Spike）蛋白突变较多。推测其出现的原因可能有以下三种情况：（1）免疫缺陷患者感染新冠病毒后，在体内经历了较长时间的进化累积了大量突变，通过偶然机会传播；（2）某种动物群体感染新冠病毒，病毒在动物群体传播过程中发生适应性进化，突变速率高于人类，随后溢出传染到人类；（3）该变异株在新冠病毒基因组变异监测落后的国家或地区持续流行了很长时间，由于监测能力不足，其进化的中间代次病毒未能被及时发现。奥密克戎变异株同时具有前4个VOC变异株Alpha（阿尔法）、Beta（贝塔）、Gamma（伽玛）和Delta（德尔塔）刺突蛋白的重要氨基酸突变位点，包括增强细胞受体亲和力和病毒复制能力的突变位点。流行病学和实验室监测数据显示，南非感染奥密克戎变异株病例数明显增加，并部分取代了Delta（德尔塔）变异株，传播力有待进一步监测研究。研究表明，新冠病毒S蛋白若出现K417N、E484A或N501Y突变，提示免疫逃逸能力增强；而奥密克戎变异株同时存在“K417N+E484A+N501Y”三重突变；此外，奥密克戎变异株还存在其他多个可能降低部分单克隆抗体中和活性的突变。突变的叠加可能降低部分抗体药物对奥密克戎变异株的保护效力，对现有疫苗免疫逃逸的能力，有待进一步监测研究。12月11日，2021大湾区科学论坛生命科学分论坛在广州举行。中国工程院院士钟南山谈及新冠病毒新毒株奥密克戎等疫情发展走势与应对等相关内容。谈到有关研究时，钟南山院士称：“
奥密克戎出来以后有什么情况还不太知道，有些国家患病率、致死率仍然比较高。为什么呢？因为我们的科技还没到那个程度。”钟南山提到：奥密克戎带来很多新的问题，目前对传播规律、致病机制、早期病例发展等都不了解，医疗和药物方面也知道较少。
他指出，“人传人”、呼吸传播，我们谈得比较多。但这个病毒从哪里来？怎么传给人类？气溶胶怎么传播等问题目前还是搞不清楚。为了能够更快更早发现病人病情，找到它的治疗靶点，我们仍需在疫苗、药物方面进行更深入的研究，这需要国内和各国在此方面，特别是有关的交叉学科共同努力。据国家卫健委官微消息，对奥密克戎变异株的基因组分析显示，其突变位点不影响我国主流核酸检测试剂的敏感性和特异性。奥密克戎变异株突变的位点主要集中在S蛋白基因的高变异区，并不位于我国第八版《新型冠状病毒肺炎防控方案》公布的核酸检测试剂引物和探针靶标区域（中国疾控中心病毒病所向全球公布的ORF1ab基因和N基因）。但南非多个实验室的数据提示，对于检测靶标为S基因的核酸检测试剂可能无法有效检出奥密克戎变异株的S基因。公众的防护是否需升级？WHO建议各国加强新冠病毒的监测、报告与研究工作，采取有效的公共卫生措施阻断病毒传播；建议个人采取的有效预防感染措施包括公共场所至少保持1米距离、佩戴口罩、开窗通风、保持手清洁、对着肘部或纸巾咳嗽或打喷嚏、接种疫苗等，同时避免去通风不良或拥挤的地方。与其他VOC变异株相比，目前尚不确定奥密克戎变异株传播力、致病性和免疫逃逸能力是否更强，相关研究在未来的几周内将得到初步结果。但目前已知的是，所有变异株都可能导致重症或死亡，因此预防病毒传播始终是关键，新冠疫苗对减少重症和死亡仍然有效。11月28日，上海市新冠肺炎临床救治专家组组长、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏医生在其个人社交账号发文，就新冠病毒变异毒株奥密克戎发表了自己的看法。全文如下：
1.奥密克戎变种被发现是近期的突发性事件，毫无疑问是病毒进化的产物。由于突变点数量远超已经发现的所有变种，预计应该是在宿主体内经历了较长时间的进化后形成。因为新冠病毒引起的是急性感染，难以在免疫功能正常者体内长时间生存与进化，也没有像流感病毒那样的基因重配发现，目前多数认为该变种可能是在免疫功能缺陷者，如艾滋病患者体内，经过长时间的携带，最终进化而成。形成新变体后，又经过偶然的机会经过传播，并迅速在传播上超越了已有的病毒传播能力，成为南非近期所记录的病毒株中的优势株（占比90%以上）。
2. 由于携带病毒突变点多，在传播上短期内似乎战胜了南非的其他病毒株，包括德尔塔毒株。因此，世卫组织出于谨慎，将其列入了密切关注变异株（VOC），也就是说要引起极大关注。
3. 但这是否已经说明全球抗疫的努力就此前功尽弃呢？现在还很难说。南非这次病毒株序列公布的总量不多，需要再观察未来两周更多的数据和实验室数据才能精准判断。
4. 南非的疫苗接种完成率低，完成全程接种的人口比例仅仅24%，自然感染率4.9%左右，其实不足以构建疫苗和自然感染的免疫屏障，没有免疫屏障就谈不上免疫突破。也就是说如果这种情况今天出现在以色列，那么可以说毫无疑问，全球抗疫要面临从头再来的风险。
5. 这里也就清楚了，为什么英国和以色列这些疫苗全程接种率超过80%，特别是以色列第三针接种率也已经达到了50%左右，这两个国家对外来输入采取的措施突然收紧。也就是说，对南非这种情况下，如果一旦明确这个病毒株可以突破原有的免疫屏障，那就意味着我们必须对已有的所有疫苗体系做调整，开始进入流感疫苗接种模式，也就是说每年要根据病毒变异情况，迅速构建新的疫苗。但是也意味着日子会变得更难。
6. 据路透社报道，为防止疫情入侵，以色列27日宣布将关闭边境，禁止所有外国旅客入境，成为全球首个因“奥密克戎”毒株而封锁国境的国家。以总理贝内特表示，这项禁令可能将持续14天，这种变异毒株“非常令人担心”，以色列“在进入紧急状态的边缘”，所有人都要严阵以待。
7. 这种情况下，可以判断，这次南非的变种病毒出现有偶然性，但是是否会对目前的初步建立的脆弱的人群免疫构成威胁，需要两周左右的观察时间。为什么初步定为两周内，是因为现在全球的流行病学数据，以及病毒中和试验数据，在两周到数周内都会出结果。这些工作我们复旦的团队和中国多个兄弟科研团队都在同步进行。不过我同意我的朋友香港大学病毒学家金冬雁教授的看法，“新冠病毒的变异是受到一定限制的，总的来讲，新冠的很多变种都没有存活下来，即使是存活下来的部分变种，其中也只有极少数能够成为优势株。从疫情暴发到现在，起码发现了上百种变异株，但只有一个德尔塔能留下来，在过去，贝塔和伽马变异株也被证明有比较强的免疫逃逸特性，但它们在和德尔塔的传播比赛中还是落败了，最后无声无息就消失了。”让我们拭目以待吧，好在不需要太长时间。
最后说下，中国怎么办。我认为对中国目前还不会产生大的影响，中国目前的快速响应与动态清零策略是可以应对各种类型的新冠变种的。
新冠病毒再变，还是新冠病毒。中国目前处于动态清零策略所赢得的战略机遇期内，正在加速构建下阶段应对常态化抗疫所需要的科学支撑，包括形成足以支撑世界开放的有效疫苗与药物储备，以及公共卫生及医疗资源储备。基于科学与团结，我们可以应对德尔塔，也能应对奥密克戎。
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