端点汇创新 走进网络药理学的世界

2021
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端点医药
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走进网络药理学的世界

       近年来,网络药理学逐渐成为中医药研究领域的热点,但大家对于网络药理学还是有些陌生。网络药理学到底是什么?它有什么魅力,能够火爆全网呢?接下来小编就带领大家了解网络药理学。

       网络药理学是基于系统生物学的理论,对生物系统的网络分析,选取特定信号节点(Nodes)进行多靶点药物分子设计的新学科。通过建立“疾病-基因-靶点-药物”相互作用网络,更好更综合的观察药物对疾病网络的干预和影响,揭示药物协同作用于人体的奥秘。

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图1.网络药理学研究的基本流程

       1、 通过液质联用或中药化学成分数据库(如TCMSP数据库、TCMID数据库、BATMAN-TCM数据库等)获取中药复方或单味中药的化学成分

       2、 根据所获得的化学成分,进入公共数据库(如PharmMapper数据库、PubChem数据库、Uniprot数据库等)对各成分相应的蛋白靶点进行预测

       3、根据已预测的蛋白靶点,进入疾病数据库(STING数据库、Genecards数据库、DrugBank数据库等)获取疾病的靶点信息,将中药各成分对应的靶点和疾病对应的靶点取交集,即为中药成分治疗疾病的潜在作用靶点

       4、采用Cytoscape或STING数据库构建成分-靶点、靶点-相关互作蛋白的网络并进行分析。利用生物信息学软件或Metascape数据库将潜在作用靶点进行GO、KEGG富集分析,初步揭示中药复方/单味中药/中药单体的作用机制,最后利用实验进行验证。

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图2.药物与疾病共有靶点Venn图(A)、PPI图(B)和可视化结果(C)

(图片来源于网络、文字内容来源于百度百科)

文献出处:

[1] Li X,Tang H,Tang Q, et al. Decoding the Mechanism of Huanglian Jiedu Decoction in Treating Pneumonia Based on Network Pharmacology and Molecular Docking[J]. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 9.

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关键词:
网络,靶点,疾病,药理学

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