宏基因组学(Metagenomics),是⼀种直接对微⽣物群体中包含的全部基因组信息进⾏研究的⼿段。
16S等扩增子只能大致回答“样品中有什么菌”的问题,而宏基因组不但能回答“样品中有什么微生物”,更重要的是能回答“样品中的微生物有什么功能”。
宏基因组学(Metagenomics),是⼀种直接对微⽣物群体中包含的全部基因组信息进⾏研究的⼿段。它规避了对样品中的微⽣物进⾏分离培养,提供了⼀种对不可分离培养的微⽣物进⾏研究的途径,更真实的反应样本中微⽣物组成、互作情况,同时在分⼦⽔平对其代谢通路、基因功能进⾏研究。
价格如下
宏基因组测序分析(促销) (DNA提取+建库+测序6G raw data+云流程分析) | |
样本数 | 单价(元) |
300份及以上 | 650 |
200-299份 | 680 |
150-199份 | 710 |
100-149份 | 740 |
40-99份 | 770 |
30-39份 | 800 |
20-29份 | 830 |
6-19份 | 840 |
1.在每份样品6G基础上增加测序分析的数据,按同一项目增加部分的总数据计算,实验+分析的费用增加60-80元/G,具体梯度如下:(1)<240G,70元/G;(2)240-599G,66元/G;(3)600-899G,62元/G;(4)900-1199G,58元/G;(5)≥1200G,54元/G。例如,100份样品测序数据12G,那么该项目从提取到分析总费用为:100*740元+(12-6)*100*62元=111200元。测序数据量指raw data。 2.如果不包DNA提取,每份样品便宜50元。 |
宏基因组云流程标准纯分析或宏基因组分箱(binning)分析(促销) | |
项目总测序数据(raw data) | 单价(元) |
≥1800G | 40元/G |
1200-1799G | 45元/G |
900-1199G | 50元/G |
600-899G | 55元/G |
240-599G | 60元/G |
180-239G | 65元/G |
120-179G | 70元/G |
36-119G | 75元/G |
注:宏基因组标准纯分析部分,基于reads或组装的分析方式二选一,如果两者都选,按照以上价格的1.5倍收费;如果同时在微科盟做宏基因组标准纯分析以及宏基因组分箱(binning)分析,两者的价格总和是以上价格的1.5倍;宏基因组分箱(binning)分析部分,不管客户给微科盟测序原始数据还是已经组装好的结果,收费标准一样。 |
宏基因组裸测(促销) (DNA提取+建库+测序6G raw data+云工具自助可视化分析) | |
样本数 | 单价(元) |
300份及以上 | 480 |
200-299份 | 500 |
150-199份 | 520 |
100-149份 | 540 |
40-99份 | 560 |
10-39份 | 580 |
注: 1.在每份样品6G基础上增加测序的数据,按同一项目增加部分的总数据计算,测序的费用增加48-58元/G,具体梯度如下:(1)<240G,58元/G;(2)240-599G,56元/G;(3)600-899G,54元/G;(4)900-1199G,52元/G;(5)1200-1799G,50元/G;(6)≥1800G,48元/G。例如,100份样品测序数据12G,那么该项目从提取到测序总费用为:100*540元+(12-6)*100*54元=86400元。测序数据量指raw data。 2.如果不包DNA提取,每份样品便宜50元。 |
技术参数
使用NovaSeq平台测序,测序策略为PE150,DNA小片段类文库插入片段为350bp。承诺指标:PE150:平均Q20≥85%,平均Q30≥80%。
novaseq
项目周期
最快只需要25个工作日!!
实验路线
样品准备→DNA检测→文库构建(加接头)→文库检测→上机测序→下机质控→信息分析
技术路线
交付结果目录
[序列质控和去宿主的相关信息]
[整体物种的注释与评估主要相关信息]
[常用的功能数据库注释相关信息]
[抗性基因注释主要相关信息]
[本报告的图表文件夹]
部分交付图表示例
宏基因数据分析系统
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