做实体瘤MRD,如果不了解Guardant Reveal,那就out了。因此,了解其技术细节和临床研究是件非常有必要的事!
⑴ 2021年2月16日,Guardant Health(GH)正式商业化Guardant Reveal液体活检产品,用于早期结直肠癌患者的MRD检测和复发监测;
*此前此前一直以LUNAR-1的名称进行开发
⑵ 2021年4月1日,GH宣布,美国纽约州卫生部临床实验室评估计划(CLEP)已批准Guardant Reveal液体活检产品用于检测和监测早期结直肠癌患者(CRC,II和III期)的MRD;
*GH可通过其现有的CLIA认证实验室以LDT的方式为纽约州早期CRC患者提供MRD检测,费用为3,500美元,TAT为7天
⑶ Guardant Reveal获CLEP批准时,尚未披露太多技术细节,参考的7篇文献综述中,1-6篇均是其他家数据,第7篇是GH自己的,但此时数据尚未公开发表;
⑷ 2021年4月29日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“(仅)使用血浆ctDNA检测结直肠癌患者微小残留病灶(MRD)”的文章,首次公开了Guardant Reveal的研究数据:MRD检测灵敏度达到91%,特异性达100%,这些发现支持了仅血浆ctDNA MRD检测的潜在临床应用;
*血浆ctDNA是一种很有前途的非侵入性生物标志物,可用于CRC和其他类型癌症治疗后MRD检测
⑸【技术路线】Guardant Reveal的MRD技术路线是Tumor-agnostic策略,也可以称之为Tumor-uninformed,即仅依赖于血浆ctDNA进行MRD检测(无需组织活检);
⑹【检测信息】Guardant Reveal检测ctDNA突变(LoD为0.01%)+ctDNA甲基化,即基于血浆cfDNA的基因组和表观基因组信息,panel大小约为0.5Mb,测序系统NovaSeq 6000;
⑺【样本要求】20ml外周血(2根10ml Streck管),8-10ml血浆,中位cfDNA含量在 60ng(如果还有公司说一管血液(10ml)能稳定检出0.01%低频突变,请直接拉黑吧,因为太不靠谱了;抽提效率+质检损耗+建库效率+捕获效率+测序深度损失,不可能做到稳定检出0.01%);
*摘自第18届肺癌高峰论坛上吴一龙教授PPT
⑻【临床研究】入组103例接受根治性手术的CRC患者,其中84例患者可评估(手术治疗39例+完成辅助治疗45例),包括I期(9.5%),II期(23.8%),III期(47.6%)和IV期(19%),首次界标采血时间(landmark timepoint)为完成最终治疗治疗后一个月(中位31.5天),并进行了1年以上的随访;
84例患者中,4例没有在最终治疗后适当的采血(被排除在外),另外10例因为治疗后样本产生的cfDNA提取量不足或未通过测序质控也被排除在主要分析之外,最终70例患者被纳入主要分析之中;
初步分析中,评估了在最终治疗完成约一个月后(平均31.5天)提取的单个首次界标血浆样本,70例可评估患者中,17/70(24%)患者在完成最终治疗后检测到ctDNA,其中15/17(88%)患者复发(特异性95.4%),由于另外2例没有复发的患者,临床随访都不到一年,所以特异性为100%(15/15),灵敏度为55.6%;
在首次界标时间点未检测到ctDNA的49例患者中,有12例(24.5%)复发,复发的灵敏度和特异性分别为55.6%和100%;
⑼ 【MRD灵敏度】Guardant Reveal的MRD检测灵敏度不是宣称可达到91%,特异性可达100%吗?为什么现在的结果却是55.6%的灵敏度和100%的特异性呢?灵敏度是虚假宣传吗?
NO,在前面写《MRD番外篇》的时候,我们其实有提到:“就目前而言,单次术后ctDNA检测的灵敏度(MRD)小于50%”,所以Guardant Reveal在首次界标采血时间(中位31.5天)的MRD灵敏度为55.6%是正常的;
⑽【纵向监测分析】MRD如何才能达到91%的灵敏度呢?先前的研究表明,纵向血浆监测(连续复发监测)可提高MRD预测复发的灵敏度,也就说在后续的时间点至少有一个可评估的纵向标本(平均每个患者3个),整合纵向标本可提高MRD灵敏度,结合监测患者的表现(临床复发4个月内),MRD灵敏度可提高到91%(55.6%→69.0%→90.9%);
⑾【甲基化与MRD】Guardant Reveal是第一个利用ctDNA突变和ctDNA甲基化的MRD分析(另一家是BNR),ctDNA突变和ctDNA甲基化分别对MRD的灵敏度贡献有多大呢?
首次界标采血时间(中位31.5天)的ctDNA突变MRD灵敏度仅有40.7%,ctDNA甲基化MRD敏度仅有48.2%,两者结合的MRD灵敏度能达到55.6%;纵向监测分析中亦是如此,单独使用ctDNA突变的MRD灵敏度分别为55.2%和72.7%,单独使用ctDNA甲基化的MRD灵敏度分别为48.3%和63.6%,但通过整合ctDNA突变和ctDNA甲基化,MRD灵敏度分别提高到69.0%和90.9%(MRD检测灵敏度相对提高25%~36%,提示ctDNA甲基化可能是MRD检测的有效方法);
⑿【CEA不能预测复发】作为比较的基础,该研究评估了标准治疗CRC血清肿瘤标志物CEA在同一队列中预测复发的能力,结果显示,CEA不能预测复发;
⒀ 在这项前瞻性队列研究中,报告了仅使用血浆分析MRD的初步结果,该分析设计用于基于肿瘤未知(tumor-uninformed)ctDNA的MRD检测,显示出良好的灵敏度和特异性,与先前报道的基于肿瘤知情方法(tumor-informed)相当;
⒁ GH目前正在进行多项前瞻性的干预性临床试验,如COBRA,PEGASUS等,利用Guardant Reveal的MRD检测来预测II/III期结肠癌术后患者的辅助治疗效果,这些前瞻性的试验可以告诉我们在ctDNA MRD环境中患者是否可以从辅助治疗中获益。
参考资料:
1.https://investors.guardanthealth.com/press-releases/press-releases/2021/Guardant-Health-Launches-Guardant-Reveal-Liquid-Biopsy-Test-for-Residual-Disease-and-Recurrence-Monitoring-in-Patients-with-Early-Stage-Colorectal-Cancer/default.aspx
2.https://investors.guardanthealth.com/press-releases/press-releases/2021/Guardant-Health-Receives-New-York-State-CLEP-Approval-for-Guardant-Reveal-Blood-Test-to-Detect-and-Monitor-Residual-Disease-in-Patients-with-Early-Stage-Cancer/default.aspx
3.https://investors.guardanthealth.com/press-releases/press-releases/2021/Study-Shows-Guardant-Reveal-Blood-Only-Liquid-Biopsy-Test-Predicts-Risk-for-Colorectal-Cancer-Recurrence-with-Industry-Leading-Sensitivity/default.aspx
4.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siravegna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
5.https://meetinglibrary.asco.org/record/194224/abstract
6.https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04068103
7.https://clinicaltrials.gov/ct2/show/record/NCT04259944
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