三种新型双抗平台: LegoBody、AliCE、mAb2

2021
04/02

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BiG生物创新社
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LegoBody可以像乐高一样随意的将不同靶点抗体进行组合。



双特异抗体 大致可以分为两类: 含Fc的双特异抗体和不含Fc的双特异抗体。 对于含Fc的双抗可以进一步分为两类——对称型和非对称型。本文简述3种双抗技术平台。


“乐高” LegoBody



图1:LegoBody双特异抗体设计


LegoBody(乐高抗体)设计中主要应用了凝血酶(Thrombin),该酶切割序列专一性强,水解效率高,被广泛用于切割标签。


凝血酶的最佳切割位点是X4-X3-P-R/K-X1-X2,其中X4和X3是疏水氨基酸,X1和X2是非酸性氨基酸。该抗体平台由加州大学旧金山分校Liu Bin 团队开发(2019年在预印本杂志biorxiv发表)。其双特异抗体设计如图1所示。


为了防止抗体重链的错配,其采用了常规的Knob-In-Hole技术;为了防止抗体轻链的错配,将抗体的轻链通过linker(GLVPRGSGSGGGSGGGSEGGGSEGGGSEGGGSEGGGSGGGSGGLVPRGS)与对应的抗体重链相连接,该linker的在轻链的C端和重链的N端都加入可以被凝血酶水解的序列(GLVPRGS),当抗体纯化后,利用凝血酶将linker切割,从而形成不含linker的双特异抗体。


经过酶切后,在抗体轻链的C端有GLVPR五个氨基酸残留,在重链的N端GS两个氨基酸残留,但是这些残留的氨基酸不影响抗体的结合活性(图2)。


图2:ELISA检查双抗结合活性(Ipilimumab:Ipili, Daratumumab:Dara)


除了可以很方便的构建双特异抗体外,LegoBody还可以很容易的构建三特异或者多特异抗体(图3)。

图3:LegoBody构建的多特异抗体



 

“2+1”AliCE



AliCE的全称为Antibody-Like Cell Engager。该双特异抗体的设计是以抗体的VH和VL形成的异源二聚体为基础。分别在VH和VL上连接Fab,形成新颖的2+1型双特异抗体(图4)。该抗体由韩国Y-BIOLOGICS公司和先进科技学院(KAIST)联合开发。
图4:AliCE双特异抗体结构示意图



AliCE双特异抗体由3条链共表达:ACE-HC-VL,ACE-HC-VL和ACE-LC。抗体的纯化利用CaptureSelectCH1-XL亲和层析柱纯化。SDS-PAGE结果证明,AliCE双抗在没有ACE-HC-VH链存在的情况下仅含有微量错配(图5C,第5泳道)。还原和非还原CE,质谱结果证明纯化后的抗体三条链的比为1:1:2没有存在错配(图5,D,E,F)。

图5:AliCE双抗设计表达及纯度和错配验证

 

稳定性方面,AliCE双抗体(ACE-05)的溶解温度在67°要高于BiTE的62°。并且抗体在室温下,不同PH溶剂中还保持很高的稳定性。


图6:AliCE双抗体稳定性


Ontarget 和Off target  :体外细胞实验结果证明AliCE双抗ACE-05可以更好的结合PD-L1阳性的细胞,明显高于BiTE-05和ACE-31,而在结合PD-L1阴性细胞方面,ACE-05明显低于BiTE-05和ACE-31(图7A),这证明ACE-05双抗有较高的特异性。而且体外杀伤实验证明ACE-05有更好的疗效(图7D/E)。


图7:AliCE双抗On target 和Off target 验证



半衰期及体内药效  : 在动物实验上,ACE-05双特异抗体在抑制肿瘤生长方面要优于BiTE-05,并且小鼠体重变化明显小于BITE-05,这说明ACE-05双特异抗体不仅药效好而且有较小的副作用。 在半衰期方面,ACE-05在大鼠和猴子体内的半衰期分别为12.5h和31h,优于BITE的4.64h和9h。


图8:体内药效及半衰期



 

“2+2”mAb2



mAb2双抗平台由F-star开发,该平台与其它双特异抗体不同,不是通过引入新的Fab,scFv或者VHH(纳米抗体),而是引入Fcab—一种可以结合抗原的Fc。Fcab的构建主要是通过对抗体Fc端的CH3区域进行改造,使CH3部分具有结合抗原的能力。


在介绍Fcab之前,我们先了解一下CH3的结构,CH3区含有3个Loop区,AB loop (R355-Q362), CD loop (S383-Y391) 和EF loop(D413-V422),其结构如图9所示。而Fcab的改造是在AB loop和EF loop区改造。 


图9:CH2和CH3 loop区(该图中序列为已经改造的CH3序列,并非是野生型CH3学列)


Fcab的改造主要是通过酵母展示系统进行筛选,首先是通过PCR构建AB loop区突变库,然后通过流式细胞仪分选能够结合目标抗原酵母。初步筛选到的Fcab结合能力会比较差,为了提高其亲和力,需要在初步筛选的基础上,再对AB loop 和EF loop进行随机突变并构建酵母展示库。经过流式细胞仪分选得到高亲和力的Fcab(与初次筛选相比,通过降低抗原的浓度筛选高亲和力的抗体)。


图10:野生型CH3氨基酸序列以及突变的AB loop和EF loop区在抗体结构中的位置



图11:酵母展示系统表达载体设计


mAb2是在单克隆抗体的基础上加入可以结合第二个抗原的Fcab形成可以结合两种抗原或者同一抗原上的两个表位的双特异抗体.该双特异抗体为2+2的形式(图12),因为改造后的Fcab为同源二聚体,且每个单体都可以结合一个抗原。该双特异抗体在表达上和单克隆抗体相同,因此与不对称双抗相比生产工艺更简单,高效。


图12:mAb2双特异抗体结构示意图


F-star管线  


F-star基于mAb2双特异抗体平台的项目共有三个,FS118,FS120和FS222,其中靶向LAG-3/PD-L1的FS118进展最快,即将开展2期临床。


图13:F-star管线



小结  


LegoBody可以像乐高一样随意的将不同靶点抗体进行组合,甚至可以在抗体的末端加入纯化标签如His-Tag或者Twin-Strep-Tag,只需要在Tag和抗体之间加入凝血酶位点即可在纯化后清除Tag序列,该技术的缺点是凝血酶酶切后会有氨基酸序列残留,另外,通过linker连接后,抗体链序列较长可能会影响抗体的表达。


AliCE为2+1形式的双特异抗体,与非对称IgG型双特异抗体相比,生产更加简单,一步亲和层析纯化后可以到达较高的纯度,在错配方面几乎观察不到错配分子。在稳定性方面,该双抗与IgG抗体类似,有较高的稳定性;关于亲和力和药效,该双抗因为可以包含两个肿瘤相关结合位点,因此比BiTE有更好的治疗效果;在Off target效应上,因为与CD3的结合结合能力较弱,因此副作用更小。依据该平台,Y-BIOLOGICS已经有两个项目正在开发中。


mAb2双特异抗体平台是在单克隆的抗体的基础上对Fc端的CH3进行改造,使其能够结合第二个抗原并形成2+2的形式,与单克隆抗体相比,其半衰期,稳定性,与Fc受体的结合能力基本相同;与其它非对称双特异抗体相比其生产工艺更加简单高效。



参考文献

1、 Shanshan Lang, Su Yang, Scott Bidlingmaier et al.LegoBody: facile generation of bispecific and multi-specific antibodies. 2019

2、Seil Jang, Jaeho Song, NaYoung Kim et al. Developmentof an antibody-like T-cell engager based on VH-VL heterodimer formation and itsapplication in cancer therapy.Biomaterials2021

3、G.Wozniak-Knopp, S.Bartl, A.Bauer et al. Introducingantigen-binding sites in structural loops of immunoglobulin constant domains: Fc fragments with engineered HER2/neu-binding sites and antibody properties. Protein Engineering 2010

4、Elisabeth Lobner, Anne-Sophie Humm, Georg Mlynek et al. Two-facedFcab prevents polymerization with VEGF and reveals thermodynamics and the 2.15 Åcrystal structure of the complex. mAbs 2017

5、F-star 官网 https://www.f-star.com/






— THE END —




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关键词:
双特异抗体,凝血酶,氨基酸,双抗,序列

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