ctDNA的发现还要早于cffDNA,早在1947年,比DNA双螺旋结构发现还早6年的时候,Mandel和Metais就发现血浆中存在游离的核酸分子
液体活检(Liquid Biopsy) 技术的个人详解
首先,我先向大家引入“液体活检”这个名词,对于这个名词的出现也就是最近几年,在临床上对于一般的肿瘤是进行手术活检和穿刺活检,医生需要对患者肿瘤进行切片,这是一种有创的检测,对于操作和取样要求极高,因此,“液体活检”应运而生,它操作简便,且能重复取样,也是MIT科技综述(MIT Technology Review)杂志公布的2015年度十大突破技术之一。
“液体活检”(Liquid Biopsy)或称 “液态活检”,对于实体肿瘤的早期诊断、用药监控、预后判断等的重要性已经日趋明朗。癌症病人血液中会存在少量游离的循环肿瘤细胞(CirculatingTumor Cell,CTC)且坏死的癌细胞亦会释放少量的循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)到血液中,因此可通过检测从肿瘤原发或转移部位释放到血液中的CTC和ctDNA来检测癌症。
目前“液体活检”按照检测样品分类,主要有两大方向:循环肿瘤细胞(circulating tumor cells, CTCs)和循环肿瘤核酸(circulating tumor DNA, ctDNA)。CTC在上一期我已经跟大家具体介绍了,那么为什么称CTC为“液体活检”呢?因为CTCs是由肿瘤原发灶和转移灶的细胞构成的,随着对肿瘤进展中的生物学变化的了解,通过外周血检测CTCs能够实时、动态的实现癌症的辅助诊断、治疗监测、复发转移监测、预后判断,因而CTC可以作为一种“液体检测”手段。
这一期我主要介绍“液体活检”另一种手段:cfDNA 。在介绍之前我先跟大家解释几个名词:
cfDNA(cellfree DNA),或者叫血浆游离DNA,是血浆中游离存在的DNA,它们有的来自于正常细胞,有的来自于异常细胞(如肿瘤细胞),还有部分来自于我们外部(如病毒DNA)。
ctDNA(circulating tumor DNA),即循环肿瘤DNA,从字面意思来讲,指的是由肿瘤细胞释放到血液循环系统中的DNA。
cffDNA(Cell-free fetal DNA),即母体外周血提取胎儿游离 DNA,通过cffDNA进行筛查,如唐氏综合征,Rh血型,性染色体异常,以及胎儿性别。
在此顺带插入介绍一下cffDNA,1997年,香港中文大学的卢煜明教授发现孕妇外周血中存在着胎儿的游离DNA,从而开创了无创产前诊断(NIPT)的新时代,无创产前基因检测现在还无法代替羊水穿刺,无创基因检测的特点,主要是弥补了普通唐筛准确性低所带来的许多无谓的羊水穿刺检查,并且弥补了许多无法进行羊水穿刺的孕妇检测唐氏儿的空白,羊水和绒毛穿刺都是一种侵入性的技术,有一定的流产风险,并不能全面推广,只能要求高龄、高危的孕妇检测。无创基因检测是2010年才开发出的新技术,而且基于其检测原理与临床应用的时间,还不能作为最终诊断标准(即使准确率有99%),羊水穿刺才能作最终诊断。
ctDNA的发现还要早于cffDNA,早在1947年,比DNA双螺旋结构发现还早6年的时候,Mandel和Metais就发现血浆中存在游离的核酸分子;1977年,Leon等人发现,肿瘤患者的血浆游离DNA水平要明显高于健康人群;可是,又过了17年,人们才发现这种携带了突变信息的循环DNA是肿瘤的标志。人们逐渐明白,cfDNA中携带肿瘤特有突变的那一小部分DNA,确确实实是由肿瘤细胞释放出来的,ctDNA的研究终于与肿瘤关联起来。
ctDNA和蛋白类标记物相比,前者的检测更灵敏,很少出现假阳性,可跟踪肿瘤的消失、扩散和复发。只需从受检者体内抽取外周血,根据受检者血液中是否含有某种肿瘤特异的游离DNA及数量的多少,精准的确认相应基因的突变频率,达到早期筛查、监控、监测疗效的目的。
ctDNA是一种无细胞状态的胞外DNA,存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中,其主要是由单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成,以DNA蛋白质复合物或游离DNA两种形式存在,血浆中ctDNA的含量很低,中位值在1%-4%之间,25%的患者接近或低于0.1%,血浆中肿瘤DNA的拷贝数也较低,中位值在50-100拷贝/mL。因此对于ctDNA的检测灵敏度要求也极高。与组织活检相比ctDNA检查微创小、无放射性污染、经济、新DNA无防腐剂污染等优点,并允许对治疗反应实时监测。
ctDNA的主要检测手段也就是增加测序深度(Sangere测序或NGS)、ddPCR(数字PCR或微滴PCR)、qPCR/Rt-PCR等。
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