非root用户,如何借助Anaconda,来安装R语言和R包
2021-01-26
作图丫
我行我show!中国医院管理案例评选,医院卓越管理实践大秀场。点击查看
导语
GUIDE ╲
非root用户 如何在conda环境下,实现安装自由?
-------以R语言和R包为例。
conda config --add channels conda-forgeconda config --add channels defaultsconda config --add channels rconda config --add channels bioconda
onda info --envs # 查看环境conda create -n r #创建名为r的独立运行的环境,这样不会由于不同程序的依赖关系而导致冲突;source activate r #进入并激活名为r的环境conda list #查看当前安装的软件conda install r-base=3.6.3 #安装R 指定为R版本为3.6.3conda deactivate # 退出当前环境conda remove --name r --all #移除r环境
source activate r conda install -c r-ggplot2 #R包通常需要以r-开头,以ggplot2为例。需要注意的是conda下面的r包的名称与普通R包的名称不一样,具体名称可以在官网上面查询(http://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/)
#用bioconductor的方式:if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")BiocManager::install("ggplot2")#用install.packages命令:install.packages(ggplot2)
root,R语言,安装,环境,命令,方式,名称

精彩评论
相关阅读
赞+1