Windows版本的高通量NGS测序文件处理工具BWA

2021-01-06 司大勇

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当测序公司测了高通量测序NGS，

比如千余元的全外显子组测序，几千元的全基因组测序，或者千元的panel测序之后，会将测序结果以fastq文本文件的gz压缩包的形式返还给实验人员或者患者。

这时候就要对文本文件，依据基因组标准文件进行拼接，拼出bam基因组文件。用到的软件，最常用的就是 bwa 和samtools。但是,这两个程序都是linux专用，在windows电脑没法用！！！

我已委托专家，正在编译最新版本的bwa和samtools到windows平台。其中bwa mem2 功能非常快，占用空间非常小。希望将来能给大家带来更方便的工具。

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