Windows版本的高通量NGS测序文件处理工具BWA

2021
01/06

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司大勇
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当测序公司测了高通量测序NGS,

比如千余元的全外显子组测序,几千元的全基因组测序,或者千元的panel测序之后,会将测序结果以fastq文本文件的gz压缩包的形式返还给实验人员或者患者。


这时候就要对文本文件,依据基因组标准文件进行拼接,拼出bam基因组文件。用到的软件,最常用的就是 bwa 和samtools。但是,这两个程序都是linux专用,在windows电脑没法用!!!

我已委托专家,正在编译最新版本的bwa和samtools到windows平台。 其中bwa mem2 功能非常快,占用空间非常小。希望将来能给大家带来更方便的工具。


本文由作者自行上传,并且作者对本文图文涉及知识产权负全部责任。如有侵权请及时联系(邮箱:nanxingjun@hmkx.cn
关键词:
高通量,NGS,BWA,基因组,显子组,文本

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