有了这个网站,我可以写一篇疾病相关综述!

2020
12/28

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医学数据库百科
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有了和疾病相关的基因了,其实在通过富集什么的就可以获得影响疾病相关的功能都是什么了

写在前面

对于临床方面的研究而言,如果我们要研究一个疾病,那么肯定要先知道这个基因之前的研究是什么一种情况,这种最经典的方式还是去看关于疾病的相关综述。随着现在网络数据库的增多,已经很多和疾病相关的数据库了,所以我们去查询这些疾病汇总的数据库去可以快速的了解一个疾病的基本研究现状了。

今天要介绍的这个数据库是汇总了多个疾病相关数据库而成的疾病相关数据库:MalaCards (https://www.malacards.org/),这个数据库汇总了来自于74个数据库的信息。


   
 
数据库使用    

这个数据库和我们前两天介绍的GeneCards是一样的,GeneCards是输入基因将就可以获得信息,这个数据库输入相关的疾病即可。例如我们检索胃癌,输入: gastric cancer


输入疾病之后,我们就跳转到了疾病信息汇总界面。对于疾病的信息,这个数据库总结了以下 几个方面。

   
 
疾病相关总结(Summaries)   

MalaCards汇总了包括 NIH、OMIM、KEGG 等多个数据库对于疾病相关的总结,通过这个部分,我们就可以了解大概的疾病背景了。

   
 
疾病相关的药物(Drugs & Therapeutic)    

既然是一个疾病,那就会涉及到和这个疾病相关的药物,MalaCards总结了DrugBank, HMDB, Dgidb, PharmGKB, IUPHAR, NovoSeek 和 BitterDB 这7个药物相关数据库,在结果当中我们可以看到和检索疾病有关的药物是哪些。

另外,这个是已经有研究的有关的药物,可能还有一些药物在做临床实验,关于临床实验相关的信息也在里面会有显示。

 
疾病相关的基因特征    

对于基础研究而言,我们还是要做基因相关的研究的,所以需要知道和疾病相关的经典基因有哪些。关于疾病相关的基因特征,主要能确定是和基相关的基因,这个结果在Genes结果当中;另外还有和疾病相关的基因变异,这个结果在Variations当中。

Genes

在和疾病相关的基因当中,数据库按照证据等级汇总了和疾病相关的经典基因。这些基因当中,按照他们自己的算法,如果是标🌟的就代表是明星基因,属于很经典的基因,如果是标CC的话,则代表在COSMIC数据库当中属于经典基因。

Variations

在基因变异方面,MalaCards 总结和和疾病相关的多个变异特征,其中包括基因多态、突变和拷贝数变异。

   
 
影响疾病的主要生物学功能   

有了和疾病相关的基因了,其实在通过富集什么的就可以获得影响疾病相关的功能都是什么了。在这个MalaCards当中汇总了和疾病相关的通路以及GO结果都有哪些。

   
 
数据库总结   

以上就是关于MalaCards的主要结果了。其他的还有比如相关的疾病、发表的文章。这个如果有需要的也可以看一眼。基本上通过这样一检索,一看,就相当于了解了一个疾病主要的信息。所以如果你的老师让你写一个和疾病相关的综述。那。。。是不是把参考参考这个数据库的结果了

本文由作者自行上传,并且作者对本文图文涉及知识产权负全部责任。如有侵权请及时联系(邮箱:nanxingjun@hmkx.cn
关键词:
Genes,数据库,疾病,基因,药物,汇总

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