患者该做哪些基因检测?全球首个二代测序(NGS)指南来了!

2020
12/17

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美中嘉和
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基因检测与肿瘤诊断,用药的关注越来越大。为了规范治疗,对于基因检测也出了指南。欢迎大家学习

科学家已经鉴定出一组特定的肿瘤DNA变化,因此肿瘤患者不再是仅根据病理分型选择化疗药物,而可以通过基因检测,发现突变位点,为患者制定更加有效、副作用更小的化疗、靶向、免疫治疗方案,以及家族癌症风险评估。

不得不说,一个患者一套方案的个体化诊疗时代已经到来。所有的肿瘤患者除了人手一份的病理报告还需要一份基因检测报告。尽管基因检测已成为临床的标准动作,但医学界尚未制定用于临床的二代测序规范指南建议

近期,欧洲医学肿瘤学会(ESMO)正式发布了首部含金量超高的转移性癌症患者二代测序指南。这份指南由ESMO转化研究和精准医学专家组参与,并基于ESCAT(分子靶点临床可行性量表,见表1)以及有效靶向药物的情况,进一步评估NGS对于每种肿瘤类型的效率和临床价值制定建议。

这也是医学界关于二代测序使用的第一个指南,将给临床医生和患者意义重大的治疗指导。

表1 分子靶点临床可行性量表(ESCAT)

ESMO:转移性癌症患者二代测序(NGS)建议

因为文献过长,这里为大家整理了四条ESMO重点建议:


  • 1.特别强调在NSCLC、胆管癌、前列腺癌和卵巢癌中使用肿瘤多基因二代测序。

  • 2.在高分化和中分化神经内分泌肿瘤(NETs)、宫颈癌、唾液癌、甲状腺癌和外阴癌中检测肿瘤突变负荷(TMB)。

  • 3.强烈建议临床研究中心在分子筛选过程进行多基因测序,增加获得新药物的机会并加速临床研究。II-IV级的很多突变对乳腺癌、胰腺癌和肝细胞癌有重要意义。

  • 4.患者的特殊注意事项*:使用大型基因组测试可能只有极少数具有临床意义的数据,但小型小组或标准测试无法检测到这些。ESMO认为患者和医生可以共同决定是否做大型基因测序。


收藏 | 八大癌症二代测序建议出炉

01 晚期非鳞状非小细胞肺癌

02 转移性乳腺癌

03 结直肠癌

04 前列腺癌

05 转移性胃癌

06 胰腺导管腺癌

07 晚期肝细胞癌

08 晚期胆管癌

肿瘤患者究竟如何选择基因检测?

这部指南的出炉给肿瘤临床基因检测提供了意义重大的指导价值,但是对于肿瘤患者来说,每个病人到底应该做哪些基因的检测,才能做到尽可能不遗漏(不错过治疗机会,不浪费标本)、又不多花冤枉钱,这里面学问很大很大……

这里针对患者最关心的几个问题进行了系统的整理和解答。

01

基因检测的方案有哪些?二代测序是什么?

肿瘤基因测试范围从简单到复杂。

最简单的测试只检测一种基因中的一种类型的突变。比如仅在BRAF位置c.1799处寻找特定T到A置换突变的试验。

最复杂的测试可以同时检测所有主要类型的基因改变,包括替换、重复、插入、缺失、插入、基因拷贝数 变异和结构变体,包括倒位和易位。

对患者来说,检测什么基因也是非常关键的,目前医院和各大基因检测公司都有针对不同人群的各类套餐,总结如下:

1

单癌种小panel检测

比如,对于肺癌患者,已知的驱动基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET,那么只检测这些常见突变的基因就可以了。


优势:价格便宜。拿肺癌举例,由于中国肺腺癌中超过一半的患者是携带EGFR和ALK两个突变之一,这种方案性价比较高。所以,如果患者属于肺腺癌,而且经济条件一般,把有限的钱用在刀刃上才是更合理的。

2

二代测序

二代测序的出现,弥补了传统单基因检测和热点基因检测的漏洞,使患者用非常宝贵的组织切片,只进行一次检测,就能获得更为精准和全面的基因分析,这也是ESMO及各类指南和临床专家一致推荐的原因。

02

为什么临床医生更推荐CGP(全面基因组测序)?

几年前,医生通常会推荐做特定癌肿的若干个基因,一般都在几个到十几个不等,这样可以为患者节省费用。而现在,经济能力允许下,医生建议尽量选择全基因检测,全面了解基因信息。

首先,癌症患者的病理标本非常有限,同样大小的组织,仅检测几个靶点浪费了宝贵的资源。全面了解癌症患者基因突变情况,为未来整个治疗过程提供分子学证据,一次检测最大获益。

第二,避免漏检。很多患者用仅有的组织标本仅做了小panel检测,结果什么都没有检测到。在一项非小细胞肺癌的研究中,仅接受EGFR,ALK,ROS1单个基因检测的患者中,10%阴性患者通过全基因组测序(NGS)再次检测结果为阳性!并且准确性得到后续临床疗效的支持。

第三,未来出现新的靶点和靶向药物时,需要重新获取患者的肿瘤组织进行基因检测,这对于很多患者非常困难。

第四,肿瘤可异病同治。癌症这种基因病是可以异病同治的!研究证实,具有相同基因改变的不同器官肿瘤患者,可以接受相同的药物治疗并获益。目前全球有大量的临床试验正在针对不同肿瘤的靶点进行治疗,仅检测几个确定的靶点,患者在现有药物耐药后,可能会丧失了许多新药物的治疗机会。

第五,很多靶向药未来可能会获批更多的适应症。如果没做全基因检测,新药上市时需要再次检测。比如奥拉帕尼最初只获批用于BRCA突变的卵巢癌和乳腺癌,慢慢的研究人员发现胰腺癌中也有部分患者存在这种突变,并且可以获益于奥拉帕尼,目前奥拉帕尼已获批用于胰腺癌。

写在最后

最后要告诉大家的是,正如医生并不能治愈每位病人,基因检测也无法为每个癌症患者创造奇迹。特鲁多说“有时去治愈,常常去帮助,总是去安慰”。对肿瘤基因检测来说,有时会带来新的治疗希望和药物选择,常常能帮助医生更全面深刻地了解每颗肿瘤,总是穷尽技术的极限寻找对患者可能有用的信息,希望大家都能通过权威的检测获得合理的用药方案。

作者 | Rossy

来源 | 环宇达康

参考文献

[1]https://www.annalsofoncology.org/article/S0923-7534(20)39971-3/fulltext


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关键词:
测序,基因,检测,肿瘤,癌症,临床

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