舒兰新型冠状病毒来源哪里?基因分析揭示新冠病毒这样传播和变异

2020
05/22

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中外医讯
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病毒来源是哪里呢?

医讯君语:目前,新冠病毒主要分为“中国型”、“欧洲型”和“美国型”,多个疫情严重的国家存在“病毒混合”现象。

据报道,1月31号,美国总统特朗普禁止过去两周曾经到访过中国的外国人进入美国。直到2月底,意大利才开始封锁城市和乡镇。当3月11日特朗普宣布他将会禁止大部分欧洲国家的游客进入美国的时候,纽约人已经带着病毒回到了纽约。

全球新冠疫情依旧严峻。据约翰·霍普金斯大学统计,截至5月21日中午,全球新冠肺炎累计确诊病例已突破500万。

世界卫生组织总干事谭德塞5月20日表示,24小时内世卫组织收到了10.6万例病例的报告,这是自疫情爆发以来新增数量最大的一天。其中几乎三分之二的新增病例仅来自于四个国家:美国、俄罗斯、巴西和印度。

而随着全球患者基因数据规模扩大,通过调查分析新型冠状病毒的遗传信息,此次疫情在全世界蔓延的状况也逐渐被弄清。

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新冠病毒传播过程中不断变异,主要分三型

新冠病毒目前主要分为“中国型”、“欧洲型”、“美国型”,分别在不同的地区发生暴发性感染。

由欧美研究人员等建立的国际数据库“GISAID”正在公布从患者当中采集的病毒的基因组(所有遗传物质的总和)。截至5月上旬已经收集了5000名患者的病毒数据。

据收集这些分析数据的“Nextstrain”透露,中国型的病毒1月中旬就开始从武汉向全世界扩散。变异后的欧洲型被认为1月下旬至2月上旬通过旅游者扩散到欧洲各国。

随后,病毒在不断变异的同时,用3~5周时间跨越了国界。肆虐欧洲的病毒类型传播到美国纽约州、巴西、非洲、亚洲等地,使疫情进一步扩大。

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在美国,除欧洲型病毒外,美国型病毒也来势汹汹。有报告称纽约州以欧洲型为主,而其他州则大都是变异后的美国型。美国型被认为是由包括中国型在内的各种类型的病毒进入美国,然后在感染者体内产生。

新冠病毒几乎每半个月就发生一次变异,根据美国德雷塞尔大学的研究团队的分析,目前已有超过17种类型。随着全球感染者不断增加,变异的速度也在加快。

如果继续变异,将有可能出现感染能力和毒性较高的新冠病毒。不过,英国伦敦大学学院教授弗朗索瓦·巴卢称“尚不清楚病毒的毒性和传染能力是否提高”。

分析者称,在所有疫情严重的地区,都发现了基因组的广泛多样性。这意味着病毒较早时期就开始在世界范围内传播。

通过分析基因组不仅能了解病毒的传播和变异情况,还能了解到防控疫情的措施是否发挥了作用。

日本国立感染症研究所发布分析报告称,3月以后疫情主要通过欧洲型蔓延到了全日本。据分析,1~2月从中国传入日本的病毒被成功阻断。后来,在欧洲流行的病毒通过回国人员带入日本,在没有采取充分措施的情况下,从城市传播到了日本全国各地。

除了560名日本国内感染者的样本外,这份分析报告还参考了国际数据库的约4500人份的样本信息。据德雷塞尔大学分析,在实施了大规模入境限制的中国大陆和香港,并没有检测出欧洲型病毒。

美国纽约人最初从欧洲携带病毒回国

据《纽约时报》4月8日报道,来自西奈山伊坎医学院的基因学家研究显示,纽约地区的新冠肺炎流行始于2月中旬,早于当前已知首位确诊病例几周的时间,同时游客们所带来的病毒主要来自于欧洲而不是亚洲。

另一个来自纽约大学格鲁斯曼医学院的团队得出了高度相似的结论,尽管他们研究的是另一组病例。两个团队分析的冠状病毒基因组都是取自3月中旬的纽约市民。

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报道称,新的病毒可以获得在原始病毒中不存在的新的突变。如果一种新的病毒设法逃离宿主并感染其他人,它的后代将继承这种变异。

追踪病毒突变需要对病毒的所有遗传物质——基因组进行排序。一旦研究人员收集到大量病毒样本的基因组,他们就可以比较它们的突变。

随着新基因组的出现,研究人员将它们上传到一个名为GISAID的在线数据库。一组病毒进化学家正在分析一个名为Nextstrain的项目中不断增长的基因组集合。

多个国家新冠病毒主要来源是美国

以色列特拉维夫大学5月18日发布的一项研究结果显示,该国约70%的新冠病例感染的病毒毒株来自美国。

特拉维夫大学联合以色列其他几所高校和医院进行的这项研究通过解码病毒基因组序列,绘制了病毒传入以色列及其在以境内传播和变异的轨迹。

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研究人员将200多名以色列本地和全球其他各地约4700名新冠患者的基因组序列进行比对后发现,约70%的以色列新冠病例感染的病毒毒株来自美国。

也就是说,来自美国的病毒携带者将病毒带到了以色列。研究还显示,其余约30%患者的感染源则主要来自英、法、比利时和意大利等欧洲国家。

此项研究的牵头人、特拉维夫大学进化病毒学家阿迪·斯特恩对当地媒体说,来自一般国家的游客通常与以色列民众的接触有限,但从美国到达以色列的人“相对与以色列民众的关系更为密切”,其中包括很多从美国回国的以色列公民。

受美国所累的不止以色列。此前,加拿大和澳大利亚等国的研究都证实,美国是其病毒的最主要来源国。

4月30日,加拿大《国家邮报》援引4个主要新冠疫情大省的统计数据报道称,虽然新冠肺炎疫情最早在中国暴发,但是把这个病毒传入加拿大的却是美国旅行者。

来自日前澳大利亚卫生部的疫情分析信息显示,澳大利亚全国发现的6900多例新冠肺炎确诊病例中,输入病例占比很高,其中,美国是澳大利亚境内病毒的最主要来源国之一,从美国输入的病例占比高达14%,而从中国输入占比还不到1%。

原标题:舒兰病毒来源哪里?基因分析揭示新冠病毒这样传播和变异

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关键词:
特拉维夫大学,冠状病毒,基因组

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