文章信息
1.研究背景
miR-125a-5p在肝细胞癌(HCC)和其他癌症中是一种肿瘤抑制因子,但在HCC肿瘤发生过程中其作用机理仍然未知。
2.方法
2.1 来自HCC患者的8对肝癌组织和邻近正常组织使用miRNA芯片(Shanghai Wcgene Biotech, Shanghai, China)比较miRNA的表达情况
2.2 细胞转染,对转染后的细胞进行qRT-PCR分析,CCK8和菌落形成试验,Western blot分析,以及免疫荧光分析。
2.3 利用数据库预测miR-125a-5p的靶基因
2.4 建立小鼠肿瘤模型
3.结果
3.1 miR-125a-5p在HCC组织和细胞系中下调
使用微阵列比较八对HCC组织和邻近正常组织中的miRNA表达。结果表明,与邻近的正常组织相比,HCC组织中的miR-125a-5p表达降低。此外,qRT-PCR表明miR-125a-5p在HCC细胞系(Bel-7404,SK-Hep1,Bel-7404和MHCC-97H)中的表达低于正常肝细胞系(L02)。
图1. (A)在八对匹配的HCC组织和相邻正常组织中差异表达的miRNA的热图。(B)qRT-PCR表明,与邻近的正常组织相比,HCC组织中的miR-125a-5p表达下调。(C)与Starbase中TCGA中相邻的正常组织相比,HCC肿瘤组织中的miR-125a-5p表达下调。(D)qRT-PCR表明,miR-125a-5p在HCC细胞系(Bel-7404,SK-Hep1,Bel-7404和MHCC-97H)中的表达低于正常肝细胞系(L02)。(E)Kaplan-Meier曲线表明,HCC患者的总体生存率与miR-125a-5p表达水平无关。
3.2 miR-125a-5p在体外抑制HCC细胞增殖并诱导其凋亡
分别通过用miR-125a-5p模拟物和抑制剂转染,在Bel-7404和SK-Hep1细胞中过表达和敲低miR-125a-5p。并通过qPCRC,CCK8和菌落形成分析,Western印迹和免疫荧光实验表明,miR-125a-5p在体外抑制HCC细胞的增殖并诱导其凋亡。
图2.(A)qRT-PCR显示,在Bel-7404和SK-Hep1细胞中,miR-125a-5p在用模拟物转染后被上调,而在抑制剂转染后被下调。(B和C)使用CCK8和集落形成测定法评估转染的Bel-7404和SK-Hep1细胞的细胞增殖能力。(D)在Bel-7404和SK-Hep1细胞中转染后,使用WB分析p53,Bax,Bcl-2和活化的caspase-3的表达。(E)转染Bel-7404和SK-Hep1细胞后,检测到caspase底物的免疫荧光染色。
3.3 PTPN1和MAP3K11是HCC中miR-125a-5p的直接靶标
使用三个靶点预测数据库预测miR-125a-5p的靶标,确定了131个共同要素(图3A)。结果表明,``JUN激酶活性的激活''是miR-125a-5p的生物学功能,而PTPN1,MAP3K9,MAP3K10和MAP3K11是miRNA的潜在靶标(图3B和3C)。在本研究的其余部分中,重点放在PTPN1和MAP3K11上。
图3.(A)使用三个靶点预测数据库预测miR-125a-5p的靶标;确定了131个共同要素。(B和C)在Cytoscape中用ClueGO和CluePedia分析了这131个靶基因。(D和F)miR-125a-5p及其在PTPN1和MAP3K11的3'-UTR中的假定结合序列。(E和G)miR-125a-5p的过表达被抑制,而敲低则增加了野生型(WT)的荧光素酶活性,但没有突变(MT),PTPN1或MAP3K11 3'-UTR。(H)通过Western印迹评估转染的Bel-7404和SK-Hep1细胞中PTPN1和MAP3K11蛋白的表达。
3.4 PTPN1和MAP3K11上调与肝癌中miR-125a-5p表达负相关
“ JUN激酶活性的激活”与数据库预测的131个常见元件相关的生物学功能之一,这意味着JNK MAPK信号通路可能对miR-125a-5p的生物学功能至关重要。
图4.(A和B)在Starbase的TCGA中PTPN1和MAP3K11被上调。(C和D)PTEP1和MAP3K11的高表达与GEPIA数据库中较差的总体存活率有关。(E和F)qRT-PCR表明,与相邻的正常组织相比,八对匹配的HCC组织中PTPN1和MAP3K11上调。(G–I)qRT-PCR和蛋白质印迹表明PTPN1和MAP3K11在HCC细胞系中上调。 (J和K)Spearman相关分析表明miR-125a-5p表达与PTPN1和MAP3K11表达负相关。
3.5 miR-125a-5p通过HCC中的MAPK信号通路抑制PTPN1和MAP3K11表达
图5. (A)Western印迹表明,miR-125a-5p的过表达减少,而miR-125a-5p的敲低增加,在Bel-7404和SK-Hep1细胞中JNK1 / 2/3和c-Jun的表达。(B和C)Western印迹显示PTPN1和MAP3K11敲低可降低Bel-7404和SK-Hep1细胞中JNK1 / 2/3和c-Jun的表达。
3.6 miR-125a-5p通过MAPK信号通路靶向PTPN1和MAP3K11,从而抑制HCC细胞增殖并诱导其凋亡
图6. (A-D)使用miR-control,miR-125a-5p抑制剂,PTPN1 siRNA 3或MAP3K11 siRNA 1转染Bel-7404和SK-Hep1细胞后,使用CCK8和集落形成测定法评估细胞增殖能力。(E和F)在Bel-7404和SK-Hep1细胞中转染后,检测到裂解的胱天蛋白酶底物的免疫荧光染色。(G和H)使用Western blot检测转染的Bel-7404和SK-Hep1细胞中PTPN1,MAP3K11,JNK1/2/3和c-Jun的表达。
3.7 miR-125a-5p通过体内的MAPK信号通路靶向PTPN1和MAP3K11,从而抑制细胞增殖并诱导凋亡
图7. (A和B)小鼠和异种移植组织的代表性图像。(C和D)异种移植组织体积和重量,miR-125a-5p的过表达被抑制,而miR-125a-5p的敲低促进了肿瘤的生长。(E)在人类蛋白图谱数据库中,HCC肿瘤组织中PTPN1和MAP3K11的表达高于正常肝组织。(F)通过免疫荧光在400x放大倍数下检测到Brdu,Ki67,PTPN1,MAP3K11,JNK1 / 2/3和c-Jun表达。miR-125a-5p的过表达减少了增殖细胞的数量并增加了凋亡细胞的数量,而miR-125a-5p的基因敲除具有相反的作用。
结论
我们的发现表明,miR-125a-5p通过MAPK信号通路直接靶向PTPN1和MAP3K11,从而抑制HCC细胞增殖并诱导细胞凋亡(图8)。因此,单独或组合使用miR-125a-5p模拟物或JNK信号抑制剂可能是治疗HCC的潜在方法。
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