搜狐科学 | Nature：基因剪刀CRISPR会导致RNA脱靶突变

【搜狐健康】随着CRISPR“基因剪刀”系统的普及，很多种新型改造过的CRISPR系统也逐渐面世。

○文/刘颖编/袁月

为了充分利用CRISPR的优势，许多研究者都会尝试让改造后的CRISPR系统进行单碱基的编辑。但据顶级科学期刊《Nature》4月17日发表的一项研究表明，改造的CRIPSR单碱基编辑系统会造成大范围的脱靶效应，即会编辑目标区域以外的基因组。

在以往研究中，科学家都会关注DNA上的脱靶效应，但是这次的新研究发现脱靶效应也会出现在RNA上，诱导RNA突变。来自麻省总医院（MGH）的一个研究小组报告说，近年来开发的几种CRISPR碱基编辑器（靶向单个DNA碱基）会导致靶标DNA以外，RNA的大范围脱靶效应。同时这一研究小组也研发了一种工程化新碱基编辑器，能显著降低RNA编辑的发生率，提高靶标DNA编辑的精确度。

肝脏和胚胎肾细胞系中的实验证明了常用的CRISPR编辑器在靶标DNA位点诱导了有效编辑，但也导致整个转录组中数万个胞嘧啶-尿嘧啶发生编辑。而且当研究人员测试一种较新的腺嘌呤靶向碱基编辑时，他们也发现了类似的结果。

文章通讯作者，MGH病理学系J.KeithJoung博士说：“大多数关于脱靶基因编辑的调查都集中在DNA上，但我们发现这种技术也可以诱导大量的RNA改变。”

为了减少这种可能性，MGH的研究人员筛选了16个改良后的编辑器，发现了两种与原始版本同样具有有效诱导靶向DNA效应，又能显著减少RNA编辑的编辑器。实际上，这些SECURE（SElectiveCurbingofUnwantedRNAEditing）甚至比未改变的脱氨酶更精确地诱导所需的DNA编辑。

Joung表示，下一步他们将会调查这些RNA效应对CRISPR碱基编辑在实验研究和临床应用的潜在影响。

资料来源

https://www.nature.com/articles/s41586-019-1161-z

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