李华兵/伊成器/吴玉章合作揭示tRNA-m1A修饰调控CD4+T细胞功能的新机制

近日，上海交通大学医学院 李华兵 研究员、北京大学生命科学学院 伊成器 教授、陆军军医大学 吴玉章 和耶鲁大学医学院  Richard Flavell  团队合作，在 Nature Immunology 期刊上发表了题为： tRNA-m1A modification promotes T cell expansion via efficient MYC protein synthesis  的研究论文。

该研究揭示了 m1A 修饰催化酶 TRMT61A 通过催化新合成 tRNA 第58位腺嘌呤的1-甲基腺嘌呤 （m1A） 修饰，加速 CD4+T 细胞激活后多种关键蛋白的翻译，保证 CD4+T 细胞的迅速免疫应答。

该研究 首次详细地阐明了 CD4+T 细胞功能改变过程中 tRNA 化学修饰控制细胞内翻译的分子机制。

T 细胞在免疫反应中发挥核心作用。当受抗原刺激时，处于静息状态的T细胞快速激活，大量增殖分化。免疫激活是免疫反应中非常重要的一步，之前的研究集中于探究转录调控在T细胞激活过程中的作用。鉴于 T 细胞激活在短时间内快速发生，转录调控不能及时满足T细胞大量合成蛋白的需求，因此翻译效率的调控可能也发挥重要作用。

tRNA 在翻译过程中发挥着重要作用。除了 tRNA 丰度之外，tRNA 上的化学修饰可以通过稳定 tRNA 结构，帮助 tRNA 进行 codon 识别等途径影响翻译过程。其中，m1A 是 tRNA 上丰度最高最保守的一种修饰，由 TRMT6/TRMT61A  复合物进行修饰，tRNA-m1A 修饰可以增强翻译起始和延伸。伊成器课题组在2017年建立了 m1A 修饰位点的单碱基分辨率鉴定技术。

该研究首先观察到 T 细胞激活过程中蛋白质翻译相关通路上调，不同的 tRNA 也表现出不同时间点上调的动态表达模式，tRNA-m1A58 修饰酶  TRMT6/TRMT61A  在激活过程中也上调。作者利用  Trmt61a  条件性敲除小鼠，证明在体内、体外条件下，Trmt61a 缺失时 T 细胞激活免疫功能受损，T 细胞增殖能力显著降低。同时，发现  rmt61a  缺失导致T细胞中大部分 tRNA 的 m1A58 修饰显著减少，导致 T细胞激活后多种关键蛋白的翻译受阻，特别是转录因子 MYC。MYC 蛋白翻译效率的降低使 T 细胞激活后的快速克隆扩增受阻。

作者随后探究了  Trmt61a  调控翻译的特异性。通过对 RiboTag-seq、tRNA-seq、tRNA-m1A-seq 的多组学联合分析，研究人员发现翻译效率下调的基因 （如Myc） 有 tRNA codon 使用偏好性，更偏好使用在激活早期高表达的 tRNA，而这部分 tRNA 又是  Trmt61a  缺失高度敏感的 tRNA。

该研究第一次将 tRNA 修饰与 T 细胞的功能变化连接起来，并系统性地探究了原代 T 细胞扩增过程中控制翻译的具体机制，表明 tRNA 的使用及其修饰可以对蛋白表达和细胞功能带来显著改变。这项研究表明 TRMT61A 介导的 tRNA-m1A58 修饰作为 CD4+T 细胞增殖调控的新型“翻译检查点”，将为改善 CD4+T 细胞介导的炎症应答及增强肿瘤免疫治疗效果提供新的 RNA 表观遗传策略。

TRMT61A介导的tRNA-m1A58修饰，是CD4+ T细胞激活增殖调控的“翻译检查点”

上海交通大学医学院刘永波博士、周静副研究员和硕士研究生施金彤，北京大学生命科学学院已出站博士后李笑雨（现浙江大学医学院研究员），博士研究生张晓婷为论文的共同第一作者，上海交通大学医学院李华兵研究员、北京大学生命科学学院伊成器教授、陆军军医大学吴玉章教授及耶鲁大学医学院 Richard A.Flavell 教授为该文的共同通讯作者。

论文链接 ：

https://www.nature.com/articles/s41590-022-01301-3