基因检测是癌症筛查、预防和治疗的有效工具。在肾细胞癌(RCC)中,VHL、FH和BAP1等具有特定组织学亚型的生殖系统致病基因变异会引发遗传性肾癌综合征已在欧洲人群中得到验证,但在亚洲人群中尚无相关研究。
导读
欧洲泌尿外协会(EAU)大会是欧洲最大、最具影响力的泌尿学会议,将展示泌尿学领域最新和最相关的科学进展。第37届EAU大会于2022年7月1日-7月4日在荷兰阿姆斯特丹召开。大会筛选出17篇摘要作为Best Abstract部分进行讨论,其中一项大规模肾癌基因分析研究的结果值得关注,医脉通整理如下。
背景
基因检测是癌症筛查、预防和治疗的有效工具。在肾细胞癌(RCC)中,VHL、FH和BAP1等具有特定组织学亚型的生殖系统致病基因变异会引发遗传性肾癌综合征已在欧洲人群中得到验证,但在亚洲人群中尚无相关研究。此外,与其他肿瘤相关的致癌基因如BRCA1/2,也尚未在RCC中进行评估。本研究开展了一项病例对照测序研究,以确定14个RCC相关基因和26个癌症易感基因的患病率和风险。
研究方法
研究者收集了1563例RCC患者和6016例对照者的数据并进行分析。研究采用基于多重PCR的靶向测序法对40个基因的所有编码区进行测序。研究采用ACMG/AMP指南和ClinVar以确定基因变异的致病性。研究采用双侧Fisher精确检验对肾透明细胞癌(ccRCC)和非肾透明细胞癌(nccRCC)进行病例-对照关联分析。P值<0.05和Bonferroni校正P值<1.25×10-3说明基因与肾癌显著相关。
研究结果
研究者确定了116种致病变异。在ccRCC患者(n=1283)中,4.05%的患者存在致癌基因导致的致病性变异,如TP53(患者组0.86%,对照组0.15%;P=1.73×10-4;OR,5.7)、CHEK2(患者组0.47%,对照组0.07%;P=3.26×10-3;OR,7.0)和PMS2(患者组0.23%,对照组0.03%;P=0.04;OR,7.0)。此外,研究者还观察到RCC相关致病基因如BAP1(患者组0.23%,对照组0.00%;P=5.47×10-3;OR,Inf)和VHL(患者组0.16%,对照组0.00%;P=0.03;OR,Inf)的致病变异。
相比之下,5.62%的nccRCC患者(n=249)主要在RCC相关基因如BAP1(患者组1.21%,对照组0.00%;P=6.27×10-4;OR,Inf)、FH(患者组1.21%,对照组0.00%;P=6.27×10-4;OR,Inf)、TSC1(患者组0.80%,对照组0.00%;P=1.58×10-3;OR,Inf)和FLCN(患者组0.80%,对照组0.03%;P=9.01×10-3;OR,24.2)中存在致病性变异。存在致病性变异的nccRCC患者诊断时间要早15.8年,且存在RCC家族史的患者比例为ccRCC的20倍。
结论
研究者进行了一项大规模病例对照研究,以评估两种主要组织学亚型中每个基因致病变异的风险和频率。以上数据表明,临床应针对每种亚型建立不同基因的检测和患者选择指南。
参考文献
Sekine Y., Iwasaki Y., Aoi T., Large-scale genomic analysis of renal cell carcinoma using 1,532 Japanese patients and 5,996 controls. 37th Annual EAU Congress. Abstract 1124.
编辑:LR 审校:LR 执行:LR
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