优点多多,复旦王永明团队等开发出高性能CRISPR工具酶

2021
03/18

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生物世界
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研究团队经过鉴定和改造,开发出了SlugCas9-HF工具酶,性能突出,它识别简单的NNGG PAM,具备活性高、精准性高、编辑范围广、基因小等优点。


CRISPR/Cas9 被誉为“基因魔剪”,是基因编辑的利器,在基础研究、农业育种和基因治疗等领域得到了广泛应用。但是CRISPR/Cas9工具还存在很多局限,常用的SpCas9编辑范围广,活性高,但是其基因较大,给病毒载体递送带来困难。常用的SaCas9基因小,但是编辑范围小。其他Cas9活性低,应用较少。

为了找到理想的Cas9工具酶,复旦大学王永明课题组建立了大规模筛选Cas9的平台,对自然界中数百种Cas9进行系统性筛查。2020年该课题组筛选到了SauriCas9,具备活性高、编辑范围广、基因小等优点,但是精准性不理想,介于SpCas9和SaCas9之间。

2021年3月15号, 王永明 课题组联合 王红艳 李继喜 课题组,在 Nucleic Acids Research 杂志发表了题为: Discovery and engineering of small SlugCas9 with broad targeting range and high specificity and activity 的研究论文。

研究团队经过鉴定和改造,开发出了 SlugCas9-HF 工具酶,性能突出 它识别简单的NNGG PAM,具备活性高、精准性高、编辑范围广、基因小等优点


研究团队同时还开发出ShaCas9SlutrCas9Sa-SlugCas9等工具。为了方便研究人员选择合适的工具酶使用,作者对本团队开发的7种工具酶和SaCas9的活性和精准性进行了比较。综合看, SlugCas9-HF在编辑活性、精准性和编辑范围都具有优势

在12个内源位点对8个工具酶活性进行比较

该研究的第一作者胡子英博士兴奋地说:“我们后继工作对SlugCas9-HF和SpCas9的活性进行了比较,它们活性没有差异。也就是说 SlugCas9-HF兼具了SpCas9和SaCas9的优点 。这是我们一直寻找的理想工具酶,它在很多场景都可以取代SpCas9和SaCas9。我们还找到很多有优点的工具酶,将陆续与同行分享。”

利用GFP报告基因对8个工具酶在脱靶位点的编辑效率进行比较。在脱靶位点编辑效率越低精准性越高

胡子英博士和张成东博士是论文的共同第一作者,王永明教授、王红艳教授和李继喜教授是论文的共同通讯作者。

论文链接:
https://doi.org/10.1093/nar/gkab148
本文由作者自行上传,并且作者对本文图文涉及知识产权负全部责任。如有侵权请及时联系(邮箱:nanxingjun@hmkx.cn
关键词:
工具酶,高性能,精准性,基因,活性

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