穿山甲是新冠病毒中间宿主?管轶团队论文再添新证!
2020年2月18日,香港大学管轶团队与广西医科大学胡艳玲课题组合作的论文发表在预印网站bioRxiv上,论文指出:穿山甲极有可能是新冠病毒的中间潜在宿主。
(图源:biorxiv.org)
研究团队对广西和广东反走私行动中缴获的多个穿山甲样本进行检测,在穿山甲样本中发现了新冠病毒的相关冠状病毒,并且在穿山甲冠状病毒、蝙蝠冠状病毒RaTG13和新冠病毒之间观察到了推测的重组信号。
背负“逃兵”骂名的病毒学专家
提到管轶,相信很多人都并不陌生。1月20日,管轶在接受财新网采访时称:武汉肺炎发展曲线与SARS高度相似。而在1月23日的时候,管轶再次接受采访,表示“连我都选择做了逃兵”、“去过武汉请自我隔离”、“有心无力,悲从心来”。此番种种言论,在当时让他背上了“造谣”、“逃兵”等各种骂名。
(图源:凤凰网)
但自从1月20日钟南山院士宣布肯定存在人传人现象以来,特别是1月24-28日,全国进入第一个发病高峰,人们开始普遍意识到:新型冠状病毒确实比SARS更“狡猾”,甚至它的传染性,要远远高于SARS,管轶教授一开始对于武汉肺炎的预判,并不是错误的。
那么,作为曾在非典战役中率先分离出SARS病毒、在此次新冠肺炎战役早期就发出预警的病毒学专家,管轶撤出武汉以后,是否真的就“置身事外”了呢?
答案是否定的。据凤凰网报道,即使饱受责难,管轶教授依然没有退出这场战役。离开武汉后,管轶及团队一直潜心于汕头大学和香港大学联合病毒研究所中,夜以继日地对这场席卷全国的新冠肺炎的来龙去脉进行科学研究。
追溯动物源病毒困难重重
病毒溯源对揭示病毒来源及其进化规律,消除疫情源头,防止疫情扩散都非常重要。但是,在疫情刚发生不久,华南海鲜市场就被清理干净,这使得追溯野生动物的源病毒变得十分困难。
(图源:新京报)
1月1日上午8时,中国疾控中心专家组赴华南海鲜城,针对病例相关商户及相关街区集中采集环境样本515份,运送至病毒病所进行检测。1月12日,病毒病所专家再次在华南海鲜市场采集野生动物贩卖商铺相关标本70份,并转运至实验室进行检测。1月22日,中国科学院院士、中国疾病预防控制中心主任高福在国新办发布会上表示,新型冠状病毒的来源是野生动物。
1月23日,中科院武汉病毒所石正丽团队在bioRxiv预印版平台上发表文章《Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin》,提出新型冠状病毒或来源于蝙蝠。
2月7日,华南农业大学官方网站发布消息称,华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室沈永义教授、肖立华教授等科研人员联合开展的最新研究表明,穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主。
(图源:华南农业大学官方网站)
而2月18日香港大学管轶团队与广西医科大学胡艳玲课题组合作发表的论文《Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China》则是继华南农业大学之后的又一力证:穿山甲很可能是新冠病毒从蝙蝠到人类的中间宿主。至此,穿山甲是继蝙蝠之后,第二种被确认携带冠状病毒的哺乳动物。
两广查获的穿山甲中均携带冠状病毒
濒临灭绝的穿山甲,为什么会成为新冠病毒的潜在中间宿主?原来,穿山甲是一种被严重走私的濒危哺乳动物,它既可被当做食材又可被当做药材。在此次研究中,管轶等人所用的马来穿山甲(Manis javanica)样本,即为2017年8月到2018年7月广西海关缴获并留存的穿山甲“药材”。
管轶团队先是对2017年8月至2018年1月期间广西海关在反走私行动中查获的18个冷冻穿山甲的43个组织样品(肺,肠,血液等)进行测序,结果显示在43个样本中的六个(两个肺,两个肠,一个肺肠混合物,一个血液)存在冠状病毒。
之后又对2018年5月至2018年7月之间缴获的12个冷冻穿山甲中的19个组织样本(九个肠组织,十个肺组织)进行qPCR检测,结果显示其中三个肺组织样本呈冠状病毒阳性。
(图源:biorxiv.org)
在这些穿山甲中发现的冠状病毒基本组,与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组相似率在85.5%-92.4%,与蝙蝠冠状病毒的相似性达到96%,在系统进化树中代表了新冠病毒的两个亚型。在冠状病毒受体结合域(RBD),穿山甲病毒与SARS-CoV-2相似度是97%,蝙蝠冠状病毒RaTG13与SARS-CoV-2相似度是89%。
(图源:123RF)
此外,在新冠疫情暴发后,广州海关技术中心重新检查了他们在以前的反走私活动中获得的5份存档的穿山甲样品(两张皮肤拭子、一个未知组织、一个鳞片)。经过高通量测序后,鳞片样本被发现含有冠状病毒读段,与2019-nCoV基因组相似度72%。
管轶在论文中同时指出,不能排除穿山甲是从蝙蝠或其他动物宿主中独立获得2019-nCoV相关病毒。因此,严厉打击野生动物走私行为,严格管制生鲜交易市场,才能从根源上杜绝此类疫情再次发生。
编辑:春雨医生
参考资料:
[1]财新网,管轶:武汉肺炎发展曲线与SARS高度相似 ,2020-01-20
[2]财新网,管轶:去过武汉请自我隔离 ,2020-01-23,http://www.caixin.com/2020-01-23/101507670.html
[3]凤凰网,管轶离开武汉后去哪了?一直在他的病毒实验室里,2020-02-18
[4]Tommy Tsan-Yuk Lam, Marcus Ho-Hin Shum, Hua-Chen Zhu,et al.Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China,doi:
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