火石研究院 | SNP检测技术对比

上一篇文章中，小编对SNP检测技术进行了盘点。发文之后，很多读者希望更为细致地了解不同技术的的分类标准、应用场景和检测成本等信息。因此小编应读者要求，编写了这篇文章，也请各位业内朋友多多指教。

1. SNP检测方法分类

1.1. 根据检测原理分类

根据检测原理进行分类，目前来说，基于杂交原理的检测方法应用更为广泛。

1.2. 根据检测通量分类

根据检测通量进行分类，可以分为高通量、中通量和低通量方法。目前中通量方法和高通量总的基因芯片法（包括beadschip）应用更为广泛。除此之外，基于Taqman方法，进行了具体技术的升级和设备耗材的替换，发明了ArrayTape法（基于Taqman原理，用塑料卷代替微孔板，用水浴锅代替PCR仪）和OpenArray（基于Taqman原理用预置了PCR引物的微孔来代替微孔板）法。

2. SNP检测方法对比

不同的检测方法适用于不同的检测场景，主要包括：消费级、临床级和研发级。目前应用广泛的是Thermo Fisher的原位芯片和Illumina的磁珠芯片。两种芯片非别为23魔方和WeGene所用的主要检测方法。目前检测价格已经下降至500元左右，并且23魔方已经把价格下降至299元。

3. 部分SNP的检测流程

3.1. Taqman法

检测周期：3-6周

检测平台：Roche LightCycher 480

3.2. SNaPshot法

检测周期：4-8周

检测平台：ABI 3730XL 测序仪

3.3. 质谱法 

检测周期：4-6周

检测平台：MassARRAY 质谱仪

4. SNP检测技术

SNP检测共20多种检测方法，针对不同细分应用，不同应用场景可以选择不同的检测方法。但是总体来说，检测成本必将随着技术水平的提高，检测量的提升会不断下降，同时也会向着更为便利和准确的方向发展。